43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4105 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  478  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03809  putative orphan protein  54.04 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  43.35 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  43.35 
 
 		 252 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  42.92 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  42.06 
 
 		 252 aa  182  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  41.13 
 
 		 251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  40.52 
 
 		 251 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  40.69 
 
 		 251 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0188  permease  45.08 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1760  permease  43.88 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2049  hypothetical protein  41.88 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366069  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  38.02 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  37.92 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3601  hypothetical protein  39.91 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816933  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2172  permease  42.77 
 
 		 177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0623  hypothetical protein  27.97 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  26.43 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  24.57 
 
 		 248 aa  68.6  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0833  hypothetical protein  26.36 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.977208  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2536  hypothetical protein  36.36 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.320016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1786  hypothetical protein  27.12 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  23.68 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  26.98 
 
 		 284 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2535  hypothetical protein  42.86 
 
 		 59 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.308945 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  23.85 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  25.89 
 
 		 344 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  24.8 
 
 		 247 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  23.58 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0977  hypothetical protein  21.59 
 
 		 244 aa  48.9  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000649549 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0601  hypothetical protein  25.83 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105908  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  25.68 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  26.04 
 
 		 255 aa  46.2  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  25 
 
 		 251 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2436  hypothetical protein  26.34 
 
 		 346 aa  45.8  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0636589 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  24.69 
 
 		 253 aa  45.4  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  24 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  21.98 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4087  hypothetical protein  25.91 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0271375  normal  0.408277 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  25.27 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  25.65 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  21.98 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  25.95 
 
 		 245 aa  42  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>