28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2436 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_2436  hypothetical protein  100 
 
 
346 aa  691    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0636589 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  53.87 
 
 
344 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6731  protein of unknown function DUF81  47.38 
 
 
344 aa  262  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.379073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  43.06 
 
 
343 aa  259  4e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  30.58 
 
 
248 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  30.09 
 
 
220 aa  102  9e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  28.25 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3790  hypothetical protein  29.12 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  23.33 
 
 
240 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.514518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  24.87 
 
 
240 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3681  hypothetical protein  23.98 
 
 
240 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.488657 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  23.63 
 
 
227 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
240 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0813  hypothetical protein  26.46 
 
 
241 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0905  hypothetical protein  26.46 
 
 
241 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.584625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2168  hypothetical protein  26.46 
 
 
241 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402805  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1944  protein of unknown function DUF81  25.94 
 
 
275 aa  52.8  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.190092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  30.09 
 
 
271 aa  47.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  26.74 
 
 
261 aa  47.4  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2536  hypothetical protein  29.29 
 
 
115 aa  47.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.320016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2787  hypothetical protein  31.41 
 
 
272 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.770752  normal  0.86011 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004140  predicted permease  31.64 
 
 
251 aa  46.6  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.835021  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2380  hypothetical protein  32.04 
 
 
240 aa  46.2  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.333988 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  26.67 
 
 
248 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0986  hypothetical protein  35.35 
 
 
270 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  30.97 
 
 
273 aa  43.5  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  26.18 
 
 
252 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  24.87 
 
 
249 aa  42.7  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>