82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0179 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  36.05 
 
 
250 aa  142  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  35.53 
 
 
255 aa  129  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  33.61 
 
 
247 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  34.32 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  31.45 
 
 
272 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  30.63 
 
 
246 aa  107  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  30.43 
 
 
252 aa  101  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  28.97 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  29.65 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  28.57 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  28.97 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  31.2 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  31.43 
 
 
250 aa  85.5  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  27.65 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  31 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  31 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  31 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  30.57 
 
 
245 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  25 
 
 
256 aa  78.6  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  31.11 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  29.39 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  27.31 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  29.39 
 
 
245 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  26.61 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  29.17 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  28.96 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  28.19 
 
 
245 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  24.56 
 
 
257 aa  71.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  30.13 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2436  hypothetical protein  28.25 
 
 
346 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0636589 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  25.35 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  27.09 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  26.79 
 
 
245 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  26.92 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  26.81 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  29 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  30.14 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  24.88 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  27.59 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  26.29 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  28.02 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  35.51 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  29.89 
 
 
246 aa  63.9  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  24.61 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0842  protein of unknown function DUF81  29.41 
 
 
243 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  30.3 
 
 
246 aa  58.9  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0963  protein of unknown function DUF81  28.68 
 
 
243 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00833564  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  25 
 
 
244 aa  58.5  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  26.73 
 
 
255 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  26.5 
 
 
243 aa  55.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  22.47 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3342  hypothetical protein  29.24 
 
 
255 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.321446  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  28.57 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  25 
 
 
248 aa  53.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14860  protein of unknown function DUF81  40.62 
 
 
278 aa  52.8  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0324626 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  23.21 
 
 
343 aa  52.4  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0623  hypothetical protein  27.73 
 
 
247 aa  52.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  25.81 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  24.46 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  23.12 
 
 
251 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  23.12 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  28.5 
 
 
254 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  25.23 
 
 
245 aa  49.7  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  20.74 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  25.32 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  28.22 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1944  protein of unknown function DUF81  23.58 
 
 
275 aa  46.2  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.190092  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1828  hypothetical protein  25.93 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.501819  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  26.54 
 
 
260 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  26.54 
 
 
260 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  26.54 
 
 
260 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1027  hypothetical protein  24.44 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1029  hypothetical protein  24.44 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0300  hypothetical protein  22.77 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000467082 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1069  hypothetical protein  24.44 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4773  hypothetical protein  26.38 
 
 
258 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4666  hypothetical protein  26.38 
 
 
258 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1650  hypothetical protein  25.32 
 
 
260 aa  43.1  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3800  hypothetical protein  22.47 
 
 
232 aa  42.4  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.926245  hitchhiker  0.000523706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15250  hypothetical protein  24.19 
 
 
260 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.206346  hitchhiker  0.0000000000944272 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  21.3 
 
 
240 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>