16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2536 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2536  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  219  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.320016 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  46.15 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  46.15 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  45.19 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  45.19 
 
 		 251 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  43.69 
 
 		 252 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  43.27 
 
 		 252 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  43.27 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3601  hypothetical protein  46.43 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816933  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03809  putative orphan protein  41.82 
 
 		 256 aa  63.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2049  hypothetical protein  46.24 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366069  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1760  permease  54.1 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  42.16 
 
 		 257 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  43.14 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2436  hypothetical protein  29.29 
 
 		 346 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0636589 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  34.72 
 
 		 246 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>