39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2049 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2049  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  496  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366069  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  82.14 
 
 		 252 aa  417  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  81.75 
 
 		 252 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  81.75 
 
 		 252 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  81.35 
 
 		 252 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  76.31 
 
 		 251 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  75.9 
 
 		 251 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  75.5 
 
 		 251 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2172  permease  82.46 
 
 		 177 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0188  permease  53.97 
 
 		 197 aa  198  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1760  permease  53.81 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03809  putative orphan protein  44.92 
 
 		 256 aa  181  9.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  41.67 
 
 		 246 aa  159  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  37.7 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  36.73 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3601  hypothetical protein  35.86 
 
 		 256 aa  130  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816933  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2536  hypothetical protein  46.24 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.320016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0601  hypothetical protein  29.49 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105908  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1786  hypothetical protein  27.03 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0623  hypothetical protein  30 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0833  hypothetical protein  28.3 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.977208  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  24.77 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  25.82 
 
 		 240 aa  49.3  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  24.48 
 
 		 240 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.514518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  20.93 
 
 		 220 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  24.56 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3681  hypothetical protein  28.28 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  26.63 
 
 		 273 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  22.57 
 
 		 227 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  23.7 
 
 		 344 aa  46.6  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  23.21 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  25.81 
 
 		 252 aa  45.8  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  23.95 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2535  hypothetical protein  37.5 
 
 		 59 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.308945 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  25.38 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  24.9 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3790  hypothetical protein  28.57 
 
 		 241 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  20.98 
 
 		 343 aa  42.7  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  21.86 
 
 		 245 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>