25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2172 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2172  permease  100 
 
 
177 aa  349  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  97.02 
 
 
252 aa  317  5e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  94.64 
 
 
252 aa  308  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  94.05 
 
 
252 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  93.45 
 
 
252 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  76.47 
 
 
251 aa  260  8e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  75.88 
 
 
251 aa  256  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  75.88 
 
 
251 aa  255  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2049  hypothetical protein  84.21 
 
 
254 aa  243  6.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366069  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0188  permease  54.88 
 
 
197 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1760  permease  50 
 
 
251 aa  141  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03809  putative orphan protein  41.95 
 
 
256 aa  137  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  42.77 
 
 
246 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  37.2 
 
 
257 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  38.04 
 
 
253 aa  114  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3601  hypothetical protein  36.31 
 
 
256 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816933  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  29.63 
 
 
273 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2535  hypothetical protein  37.29 
 
 
59 aa  47.8  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.308945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  26.67 
 
 
255 aa  47.8  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0601  hypothetical protein  28.37 
 
 
248 aa  45.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105908  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  26.98 
 
 
245 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1786  hypothetical protein  25.96 
 
 
254 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  26.98 
 
 
245 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  26.98 
 
 
245 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  27.61 
 
 
247 aa  40.8  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>