21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0623 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0623  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  474  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0601  hypothetical protein  44.35 
 
 
248 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105908  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0833  hypothetical protein  44.35 
 
 
244 aa  180  2e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.977208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1786  hypothetical protein  44.2 
 
 
254 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  30.18 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  29.6 
 
 
252 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3601  hypothetical protein  34.29 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816933  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  31.25 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  29.65 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  28.7 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  28.7 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  28.77 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2049  hypothetical protein  30.18 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366069  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  27.86 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03809  putative orphan protein  27.51 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  25.22 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  24.71 
 
 
257 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  24.71 
 
 
253 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  27.73 
 
 
240 aa  52.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  23.96 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0188  permease  29.89 
 
 
197 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>