39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2158 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 252 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  96.83 
 
 		 252 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  95.24 
 
 		 252 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  95.24 
 
 		 252 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  77.51 
 
 		 251 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  76.31 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  76.31 
 
 		 251 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2049  hypothetical protein  82.14 
 
 		 254 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366069  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2172  permease  94.05 
 
 		 177 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0188  permease  55.03 
 
 		 197 aa  203  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03809  putative orphan protein  46.93 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1760  permease  52.79 
 
 		 251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  42.11 
 
 		 246 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  37.96 
 
 		 257 aa  144  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  38.52 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3601  hypothetical protein  37.85 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816933  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2536  hypothetical protein  43.27 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.320016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1786  hypothetical protein  29.24 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0623  hypothetical protein  29.65 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0601  hypothetical protein  27.35 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105908  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0833  hypothetical protein  29.44 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.977208  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  23.62 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  25.33 
 
 		 240 aa  52.8  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2544  protein of unknown function DUF81  26.63 
 
 		 273 aa  49.3  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.367735  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2535  hypothetical protein  38.98 
 
 		 59 aa  48.9  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.308945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  27.63 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  23.89 
 
 		 240 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.514518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  29.89 
 
 		 240 aa  46.6  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  24.34 
 
 		 227 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  22.33 
 
 		 248 aa  45.4  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3681  hypothetical protein  28.74 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  23.24 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  23.08 
 
 		 344 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  24.4 
 
 		 266 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  25.22 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  26.87 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2717  hypothetical protein  31.65 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3790  hypothetical protein  29.21 
 
 		 241 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  25 
 
 		 284 aa  42  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>