36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3790 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3790  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  471  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  61.76 
 
 		 240 aa  288  7e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.514518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  62.18 
 
 		 240 aa  285  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3681  hypothetical protein  62.18 
 
 		 240 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488657 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  59.38 
 
 		 227 aa  281  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  47.08 
 
 		 240 aa  209  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2168  hypothetical protein  48.4 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402805  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0813  hypothetical protein  48.4 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0905  hypothetical protein  48.4 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.584625  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1761  hypothetical protein  41.72 
 
 		 156 aa  122  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.758553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  27.43 
 
 		 248 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2278  hypothetical protein  29.24 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0545786  normal  0.385005 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  25 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  23.67 
 
 		 344 aa  72  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6731  protein of unknown function DUF81  28 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379073 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  25.21 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2436  hypothetical protein  29.12 
 
 		 346 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0636589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  28.69 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  32.14 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  30.68 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  30.68 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  30.34 
 
 		 252 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  22.57 
 
 		 243 aa  46.2  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  30.68 
 
 		 252 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  25.31 
 
 		 237 aa  45.4  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  28.79 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  26.47 
 
 		 260 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  31.73 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3800  hypothetical protein  25.13 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.926245  hitchhiker  0.000523706 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  29.21 
 
 		 252 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  23.9 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  27.64 
 
 		 254 aa  42.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1786  hypothetical protein  25.47 
 
 		 254 aa  42  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  26.11 
 
 		 252 aa  42  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  26.57 
 
 		 255 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  25.86 
 
 		 300 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>