36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0070 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2868  hypothetical protein  76.79 
 
 		 240 aa  331  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6829  protein of unknown function DUF81  77.58 
 
 		 240 aa  330  7.000000000000001e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.514518 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3681  hypothetical protein  76.23 
 
 		 240 aa  323  9e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.488657 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3790  hypothetical protein  59.38 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2168  hypothetical protein  52.75 
 
 		 241 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.402805  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0905  hypothetical protein  52.75 
 
 		 241 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.584625  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0813  hypothetical protein  52.75 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3148  protein of unknown function DUF81  43.44 
 
 		 240 aa  175  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1761  hypothetical protein  39.47 
 
 		 156 aa  123  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.758553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  28.44 
 
 		 248 aa  105  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  27.36 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  25.65 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2278  hypothetical protein  29.95 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0545786  normal  0.385005 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  24.35 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6731  protein of unknown function DUF81  24.14 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2436  hypothetical protein  23.63 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0636589 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  25 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  27.88 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  24.23 
 
 		 291 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  24.55 
 
 		 251 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  24.55 
 
 		 251 aa  48.9  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  26.73 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  24.34 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6144  hypothetical protein  28.88 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  23.79 
 
 		 291 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  23.79 
 
 		 291 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  23.79 
 
 		 291 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  23.89 
 
 		 252 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  24.34 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4361  hypothetical protein  27.23 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0967728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  21.05 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4519  hypothetical protein  25.58 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  28.9 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3800  hypothetical protein  25.65 
 
 		 232 aa  42  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.926245  hitchhiker  0.000523706 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  25.16 
 
 		 252 aa  42  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>