17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2535 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2535  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.308945 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  42.86 
 
 		 246 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0188  permease  45.28 
 
 		 197 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  40.68 
 
 		 257 aa  50.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  40.68 
 
 		 253 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1760  permease  45 
 
 		 251 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3601  hypothetical protein  48.15 
 
 		 256 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  38.98 
 
 		 252 aa  48.9  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2172  permease  37.29 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  37.29 
 
 		 252 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  37.29 
 
 		 252 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  37.29 
 
 		 252 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03809  putative orphan protein  39.29 
 
 		 256 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2049  hypothetical protein  37.5 
 
 		 254 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366069  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  37.29 
 
 		 251 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  37.29 
 
 		 251 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  37.29 
 
 		 251 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>