29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3601 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3601  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  490  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816933  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4178  protein of unknown function DUF81  45.2 
 
 		 253 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3987  hypothetical protein  44.8 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03809  putative orphan protein  40.86 
 
 		 256 aa  158  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2199  hypothetical protein  37.9 
 
 		 252 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.496547  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  37.85 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  37.5 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  37.1 
 
 		 252 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1997  hypothetical protein  38.4 
 
 		 251 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00150485  hitchhiker  0.00000598022 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1978  hypothetical protein  38.4 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  hitchhiker  0.00218307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2084  permease  37.97 
 
 		 251 aa  149  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000225949  decreased coverage  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  38.42 
 
 		 246 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0188  permease  40.74 
 
 		 197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1760  permease  43.24 
 
 		 251 aa  125  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.454251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2049  hypothetical protein  36.36 
 
 		 254 aa  124  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.366069  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2172  permease  36.31 
 
 		 177 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2536  hypothetical protein  46.43 
 
 		 115 aa  90.5  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.320016 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0623  hypothetical protein  34.29 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.189597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0833  hypothetical protein  32.77 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.977208  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0601  hypothetical protein  30.25 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.105908  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1786  hypothetical protein  29.06 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  23.15 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2535  hypothetical protein  48.15 
 
 		 59 aa  48.9  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.308945 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2436  hypothetical protein  28.95 
 
 		 346 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0636589 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  32.95 
 
 		 291 aa  45.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  32.95 
 
 		 291 aa  45.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  32.95 
 
 		 291 aa  45.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2628  hypothetical protein  29.61 
 
 		 272 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.975369  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0070  hypothetical protein  24.85 
 
 		 227 aa  42.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.737418  hitchhiker  0.00889928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>