83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3625 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  482  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  76.73 
 
 		 245 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  76.33 
 
 		 245 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  76.73 
 
 		 245 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  76.73 
 
 		 245 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  76.73 
 
 		 245 aa  378  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  76.33 
 
 		 245 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  75.92 
 
 		 245 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  44.81 
 
 		 249 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  41.46 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  39.84 
 
 		 251 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  43.1 
 
 		 244 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  41.83 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  41.18 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  41.06 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  42.97 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  38.89 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  36.14 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  37.24 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  40.71 
 
 		 256 aa  155  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  41.98 
 
 		 252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  42.98 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  37.92 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  37.92 
 
 		 245 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  36.58 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  36.72 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  37.7 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  36.96 
 
 		 250 aa  138  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  39.91 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  35.54 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  34.02 
 
 		 244 aa  129  3e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  35.68 
 
 		 255 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  33.06 
 
 		 282 aa  122  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  35.1 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  36.49 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  33.05 
 
 		 260 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  33.05 
 
 		 260 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  34.44 
 
 		 260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  32.64 
 
 		 260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  36.49 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  34.85 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  34.69 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  34.71 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  38.8 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  30.35 
 
 		 272 aa  101  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  32.61 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  30.8 
 
 		 250 aa  99  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  33.46 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  30.14 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  26.47 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  28.76 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  37.38 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  29.28 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  30.71 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  28.14 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  25.56 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  24.46 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4878  protein of unknown function DUF81  28.49 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000490098  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1386  hypothetical protein  24.81 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.187593  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0846  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  26.7 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14860  protein of unknown function DUF81  47.17 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0324626 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2445  hypothetical protein  33.8 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.315917  normal  0.587426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  23.08 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2938  hypothetical protein  27.03 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.436865 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  24.18 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  24.18 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1583  protein of unknown function DUF81  24.9 
 
 		 307 aa  46.6  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2841  hypothetical protein  28.06 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2208  protein of unknown function DUF81  28.36 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0668214  normal  0.605026 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3036  protein of unknown function DUF81  22.5 
 
 		 261 aa  45.4  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2307  hypothetical protein  27.61 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0952634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2158  protein of unknown function DUF81  26.87 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0322599  hitchhiker  0.000748002 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  27.56 
 
 		 344 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0970  protein of unknown function DUF81  25.86 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0270305  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2172  permease  27.61 
 
 		 177 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0733  hypothetical protein  26.06 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.433775  hitchhiker  0.00000299502 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  24.11 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  26.56 
 
 		 265 aa  43.5  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2053  hypothetical protein  23.56 
 
 		 274 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0777  hypothetical protein  25.41 
 
 		 259 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31561  predicted protein  25.74 
 
 		 322 aa  42.4  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1879  hypothetical protein  26.36 
 
 		 243 aa  42  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.518881  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>