76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1586 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  484  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  80.88 
 
 		 251 aa  368  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  74.3 
 
 		 252 aa  335  5e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  62.95 
 
 		 255 aa  290  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  55.1 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  43.9 
 
 		 245 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  43.9 
 
 		 245 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  43.9 
 
 		 245 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  43.5 
 
 		 245 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  43.9 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  43.9 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  43.5 
 
 		 245 aa  188  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  42.17 
 
 		 257 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  43.8 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  39.27 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  41.56 
 
 		 261 aa  169  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  42.13 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  38.34 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  37.7 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  42.97 
 
 		 250 aa  158  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  36.25 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  43.7 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  39.84 
 
 		 247 aa  155  7e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  38.96 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  39.2 
 
 		 259 aa  149  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  36.11 
 
 		 254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  35.2 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  37.55 
 
 		 245 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  36.07 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  36.8 
 
 		 255 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  36.33 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  34.54 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  35.77 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  34.94 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  36.18 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  33.2 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  34.14 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  33.73 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  38.95 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  32.55 
 
 		 255 aa  99  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  28.57 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  30.89 
 
 		 259 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  28.19 
 
 		 301 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  29.88 
 
 		 260 aa  90.5  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  29.75 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  29.75 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  29.34 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  30.38 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  27.31 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  29.02 
 
 		 246 aa  78.6  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  27.48 
 
 		 252 aa  72  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0127  protein of unknown function DUF81  28.28 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000037107  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  30.23 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  30.26 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  26.19 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  25.88 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  25.88 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4105  hypothetical protein  24.16 
 
 		 246 aa  52  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  24.89 
 
 		 344 aa  51.6  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14860  protein of unknown function DUF81  42.62 
 
 		 278 aa  48.5  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0324626 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  25.89 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  25.89 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  25.89 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1940  hypothetical protein  27.16 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000335524  normal  0.789392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  26.87 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2505  hypothetical protein  29.61 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00117063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  23.89 
 
 		 343 aa  45.8  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  22.32 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  25.45 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2375  protein of unknown function DUF81  29.12 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4272  protein of unknown function DUF81  26.59 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  23.26 
 
 		 246 aa  42.7  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  29.7 
 
 		 245 aa  42.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2202  hypothetical protein  26.92 
 
 		 251 aa  42  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0392424  normal  0.159254 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  30.38 
 
 		 247 aa  42  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>