20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1851 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1851  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  286  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.749637  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  47.83 
 
 		 253 aa  153  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5307  protein of unknown function DUF81  58.57 
 
 		 249 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.367443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0039  protein of unknown function DUF81  57.93 
 
 		 249 aa  144  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.162734  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5385  protein of unknown function DUF81  60.71 
 
 		 249 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4839  hypothetical protein  58.57 
 
 		 249 aa  138  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.21149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  55 
 
 		 251 aa  137  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4336  hypothetical protein  55 
 
 		 270 aa  135  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0600848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2500  hypothetical protein  48.65 
 
 		 251 aa  129  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.617054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4283  hypothetical protein  64.35 
 
 		 250 aa  124  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.293053  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5622  hypothetical protein  54.29 
 
 		 248 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0021  hypothetical protein  57.55 
 
 		 247 aa  102  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.7077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  46.4 
 
 		 243 aa  83.6  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  39.67 
 
 		 248 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  38.66 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3894  hypothetical protein  35.92 
 
 		 253 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0181747 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6166  hypothetical protein  35.92 
 
 		 253 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00176051  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3972  hypothetical protein  35.21 
 
 		 250 aa  60.1  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.965925 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8662  protein of unknown function DUF81  39.22 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3491  hypothetical protein  32.09 
 
 		 242 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.401485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>