63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2668 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  66.4 
 
 		 254 aa  328  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  65.6 
 
 		 254 aa  326  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  62.7 
 
 		 255 aa  315  6e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  55.38 
 
 		 257 aa  275  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  42.86 
 
 		 244 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  47.01 
 
 		 256 aa  191  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  42.91 
 
 		 255 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  41.18 
 
 		 259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  41.5 
 
 		 250 aa  172  5.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  41.27 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  40.4 
 
 		 252 aa  169  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  41.67 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  37.8 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  37.04 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  40.08 
 
 		 245 aa  158  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  40.08 
 
 		 245 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  40.08 
 
 		 245 aa  158  7e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  40.93 
 
 		 250 aa  158  8e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  38.62 
 
 		 245 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  38.62 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  38.1 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  39.69 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  41.34 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  39.69 
 
 		 245 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  39.69 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  39.68 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  37.26 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  36.44 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  37.7 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  35.1 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  36.44 
 
 		 282 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  35.1 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  38.1 
 
 		 252 aa  132  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  36.02 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  42.97 
 
 		 247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  31.08 
 
 		 260 aa  122  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  40.49 
 
 		 246 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  31.54 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  32.11 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  32.11 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  32.11 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  38.6 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  33.6 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  26.41 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  26.91 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  24.39 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  26.1 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  24.42 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  26.81 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  28.14 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  27.71 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  25.76 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  24.18 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  26.89 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  25.11 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4251  putative domain of unknown function  24.24 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4342  hypothetical protein  24.24 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4296  hypothetical protein  24.24 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  26.22 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14860  protein of unknown function DUF81  31.58 
 
 		 278 aa  49.3  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0324626 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  23.83 
 
 		 247 aa  46.2  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  26.14 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>