61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5796 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  98.85 
 
 
260 aa  503  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  77.69 
 
 
260 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  73.71 
 
 
259 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  33.6 
 
 
255 aa  132  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  30.77 
 
 
257 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  32.11 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  33.47 
 
 
245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  34.57 
 
 
245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  34.57 
 
 
245 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  33.47 
 
 
245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  33.47 
 
 
245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  31.15 
 
 
249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  34.16 
 
 
245 aa  113  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  32.37 
 
 
244 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  33.2 
 
 
245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  32.24 
 
 
254 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  31.43 
 
 
254 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  32.08 
 
 
245 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  32.08 
 
 
245 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  32.08 
 
 
252 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  34.16 
 
 
253 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  32.26 
 
 
253 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  32.23 
 
 
244 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  30.86 
 
 
259 aa  102  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  32.38 
 
 
255 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  32.37 
 
 
245 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  33.33 
 
 
282 aa  99.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  32.11 
 
 
256 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  33.61 
 
 
246 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  32.07 
 
 
250 aa  93.2  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  33.05 
 
 
247 aa  93.2  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  31.8 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  31.05 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  30.61 
 
 
250 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  29.69 
 
 
252 aa  82.8  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  31.54 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  27.73 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  29.83 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  30.13 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  29.44 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  26.19 
 
 
261 aa  70.5  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  28.92 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  28.71 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  32.57 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  31.87 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  27.71 
 
 
239 aa  56.2  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  27 
 
 
255 aa  52.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  26.75 
 
 
246 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  26.94 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  32.45 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4878  protein of unknown function DUF81  25.48 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000490098  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  24.49 
 
 
263 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  26.54 
 
 
240 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  29.05 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  24.8 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  23.3 
 
 
253 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  23.3 
 
 
251 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  26.44 
 
 
272 aa  43.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14860  protein of unknown function DUF81  40.35 
 
 
278 aa  42.4  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0324626 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>