60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3181 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  55.38 
 
 
260 aa  275  5e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  55.78 
 
 
255 aa  264  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  54.76 
 
 
254 aa  264  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  54.4 
 
 
254 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  48.24 
 
 
255 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  48.24 
 
 
256 aa  214  8e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  48.52 
 
 
244 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  48.02 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  47.45 
 
 
276 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  44.35 
 
 
253 aa  191  8e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  44.35 
 
 
253 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  43.02 
 
 
259 aa  189  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  41.34 
 
 
252 aa  188  7e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  44.94 
 
 
282 aa  185  5e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  42.86 
 
 
245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  42 
 
 
245 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  42.86 
 
 
245 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  42.91 
 
 
245 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  42.45 
 
 
250 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  42.91 
 
 
245 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  42.91 
 
 
245 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  43.09 
 
 
245 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  42.17 
 
 
251 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  41.37 
 
 
252 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  43.5 
 
 
245 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  43.21 
 
 
245 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  43.5 
 
 
245 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  42.69 
 
 
255 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  40.17 
 
 
249 aa  176  5e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  43.43 
 
 
250 aa  175  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  41.2 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  41.18 
 
 
252 aa  159  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  41.49 
 
 
244 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  44.4 
 
 
252 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  44.81 
 
 
246 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  41.63 
 
 
247 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  32.79 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  33.72 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  30.77 
 
 
260 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  30.77 
 
 
260 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  30.77 
 
 
260 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  42.39 
 
 
246 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  37.3 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  28.63 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  30.52 
 
 
272 aa  87.4  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  28 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  29.65 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  29.2 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  24.56 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  30.36 
 
 
258 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  25.7 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  27.06 
 
 
245 aa  53.9  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  28.16 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1229  protein of unknown function DUF81  27.41 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559154  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  26.4 
 
 
255 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14860  protein of unknown function DUF81  42.31 
 
 
278 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0324626 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  28.04 
 
 
301 aa  46.2  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  28.06 
 
 
263 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  25.82 
 
 
254 aa  42.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.670843 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>