60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2917 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  489  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  63.56 
 
 		 250 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  41.8 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  40.08 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  38.43 
 
 		 246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  35.69 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  37.75 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  33.61 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  32.63 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  33.05 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  33.05 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  32.64 
 
 		 245 aa  97.1  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  32.64 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  29.91 
 
 		 249 aa  95.1  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  31 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  34.78 
 
 		 245 aa  92  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  34.06 
 
 		 245 aa  91.7  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  34.06 
 
 		 245 aa  91.7  9e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  28.89 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  32.13 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  33.9 
 
 		 250 aa  89  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  29.1 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  30.77 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  29.26 
 
 		 244 aa  86.7  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  26.47 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  46.94 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  25.63 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  30.4 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  26.41 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  29.63 
 
 		 252 aa  78.6  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  34.36 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  29.65 
 
 		 257 aa  77.4  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  29.87 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  27.23 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  33.03 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  27.23 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  32.61 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  32.45 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  31.19 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  27.15 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  28.44 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  26.87 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  28.86 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  27.05 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  33.14 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  26.57 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  32.57 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  25.44 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  32.57 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  30.9 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14860  protein of unknown function DUF81  50.79 
 
 		 278 aa  62  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0324626 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  29.22 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  29.87 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  26.05 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2072  hypothetical protein  26.58 
 
 		 248 aa  48.9  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.361512 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22320  protein of unknown function DUF81  26.28 
 
 		 255 aa  47  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  24.76 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2351  hypothetical protein  27.56 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1986  protein of unknown function DUF81  27.56 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.368291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0506  hypothetical protein  33.66 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0953317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>