39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1702 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1702  hypothetical protein  100 
 
 
254 aa  462  1e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0934945  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  33.05 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3833  protein of unknown function DUF81  34.13 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4254  hypothetical protein  31.11 
 
 
245 aa  62  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.600925 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  30.53 
 
 
244 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  30.08 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1317  protein of unknown function DUF81  29.83 
 
 
263 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22430  hypothetical protein  31.56 
 
 
243 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  27.93 
 
 
258 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3856  hypothetical protein  28.5 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.497532  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0558  hypothetical protein  28 
 
 
243 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  23.39 
 
 
272 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0614  hypothetical protein  26.58 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1229  protein of unknown function DUF81  31.87 
 
 
263 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.559154  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  26.92 
 
 
240 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0695  hypothetical protein  30.74 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0136  hypothetical protein  31.6 
 
 
262 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1263  membrane protein  26.91 
 
 
242 aa  46.6  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4058  hypothetical protein  27.67 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3441  hypothetical protein  26.57 
 
 
247 aa  46.2  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  27.01 
 
 
240 aa  45.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3616  hypothetical protein  26.57 
 
 
247 aa  45.8  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.632032  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0518  hypothetical protein  28.25 
 
 
246 aa  45.8  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1086  hypothetical protein  27.6 
 
 
250 aa  45.8  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0866441 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4163  hypothetical protein  25.54 
 
 
246 aa  45.4  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0534  hypothetical protein  28.25 
 
 
247 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0510  hypothetical protein  26.09 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0115  protein of unknown function DUF81  32.06 
 
 
262 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.117057  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  27.78 
 
 
245 aa  44.3  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  33.71 
 
 
250 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1591  protein of unknown function DUF81  27.19 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0129546  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0354  protein of unknown function DUF81  26.73 
 
 
239 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  27.06 
 
 
240 aa  43.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5981  hypothetical protein  30.25 
 
 
248 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.561817  normal  0.461484 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0562  protein of unknown function DUF81  28.18 
 
 
247 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3778  hypothetical protein  28.18 
 
 
247 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1865  hypothetical protein  28.63 
 
 
251 aa  42.4  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.349812 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  32.97 
 
 
240 aa  42.4  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0558  hypothetical protein  27.73 
 
 
247 aa  42  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>