19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3771 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3771  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  489  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4367  protein of unknown function DUF81  67.73 
 
 
253 aa  329  2e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.688319 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1995  hypothetical protein  70.83 
 
 
255 aa  328  8e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0689  hypothetical protein  68.16 
 
 
253 aa  324  8.000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309902  normal  0.362532 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4518  hypothetical protein  68.33 
 
 
255 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.535232 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6207  hypothetical protein  62.55 
 
 
253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.449503  normal  0.698789 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0522  hypothetical protein  37.44 
 
 
250 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5696  protein of unknown function DUF81  34.96 
 
 
259 aa  111  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0936  putative integral membrane protein  34.45 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03786  putative integral membrane protein  35.34 
 
 
250 aa  105  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  27.87 
 
 
240 aa  50.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13510  protein of unknown function DUF81  28.46 
 
 
237 aa  50.1  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2961  protein of unknown function DUF81  24.26 
 
 
248 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.6614 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  29.36 
 
 
238 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  28.78 
 
 
261 aa  45.4  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  26.87 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  28.92 
 
 
240 aa  43.1  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4756  hypothetical protein  29.03 
 
 
251 aa  42.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1898  protein of unknown function DUF81  25.32 
 
 
247 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>