17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5696 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5696  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 259 aa  502  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0936  putative integral membrane protein  48.76 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4518  hypothetical protein  33.74 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.535232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1995  hypothetical protein  34.15 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3771  hypothetical protein  34.96 
 
 		 256 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.777137  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4367  protein of unknown function DUF81  31.82 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.688319 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0689  hypothetical protein  31.22 
 
 		 253 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.309902  normal  0.362532 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6207  hypothetical protein  32.65 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.449503  normal  0.698789 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03786  putative integral membrane protein  35.59 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0522  hypothetical protein  34.96 
 
 		 250 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0203  hypothetical protein  34.86 
 
 		 216 aa  52.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0189  hypothetical protein  27.31 
 
 		 240 aa  48.9  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  27.21 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0831  protein of unknown function DUF81  28.22 
 
 		 253 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05889  hypothetical protein  29.41 
 
 		 240 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0613  hypothetical protein  36.59 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000279  hypothetical protein  28.19 
 
 		 240 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>