59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3569 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
254 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  95.67 
 
 
254 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  66.4 
 
 
260 aa  328  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  60.71 
 
 
255 aa  296  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  54.4 
 
 
257 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  45.8 
 
 
244 aa  189  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  44 
 
 
255 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  44.8 
 
 
276 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  43.82 
 
 
256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  38.53 
 
 
252 aa  159  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  42 
 
 
254 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  38.98 
 
 
252 aa  155  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  39.84 
 
 
245 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  38.19 
 
 
259 aa  152  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  39.67 
 
 
245 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  39.67 
 
 
245 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  37.45 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  36.47 
 
 
255 aa  141  9e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  39.47 
 
 
282 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  38.57 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  38.57 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  40.49 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  39.39 
 
 
244 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  35.32 
 
 
251 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  35.74 
 
 
245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  35.74 
 
 
245 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  35.74 
 
 
245 aa  136  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  35.74 
 
 
245 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  32.77 
 
 
249 aa  135  8e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  35.74 
 
 
245 aa  132  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  35.74 
 
 
245 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  35.74 
 
 
245 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  36 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  41.39 
 
 
246 aa  122  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  37.35 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  34.47 
 
 
252 aa  119  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  36.25 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  32.24 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  32.24 
 
 
260 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  31.84 
 
 
260 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  39.04 
 
 
246 aa  105  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  29.8 
 
 
260 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  35.1 
 
 
247 aa  102  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  32.43 
 
 
259 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  27.95 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  28.63 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  25.63 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  24.36 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  26.92 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  27.53 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  28.02 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  27.39 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  26.55 
 
 
246 aa  59.7  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  23.93 
 
 
301 aa  59.3  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0160  hypothetical protein  29.84 
 
 
250 aa  49.3  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0211  hypothetical protein  26.81 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2849  protein of unknown function DUF81  26.96 
 
 
261 aa  42  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1485  hypothetical protein  29.89 
 
 
255 aa  42  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22430  protein of unknown function DUF81  27.36 
 
 
238 aa  42  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.745875  normal  0.877077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>