64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4327 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4327  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 252 aa  487  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0756553 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0054  protein of unknown function DUF81  44.09 
 
 		 255 aa  202  6e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01280  protein of unknown function DUF81  44.76 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2917  hypothetical protein  39.27 
 
 		 247 aa  169  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.862692 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2996  hypothetical protein  38.98 
 
 		 246 aa  158  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.497754  normal  0.595965 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2451  hypothetical protein  36.39 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2981  hypothetical protein  34.87 
 
 		 250 aa  151  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1689  protein of unknown function DUF81  37.3 
 
 		 252 aa  135  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0179  hypothetical protein  30.43 
 
 		 240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14860  protein of unknown function DUF81  41.07 
 
 		 278 aa  122  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0324626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3677  hypothetical protein  29.11 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2398  hypothetical protein  34.23 
 
 		 252 aa  102  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.253445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3270  protein of unknown function DUF81  27.92 
 
 		 254 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.726998 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1291  hypothetical protein  32.07 
 
 		 252 aa  92  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000742874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0652  hypothetical protein  30.18 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2774  hypothetical protein  28.33 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3569  protein of unknown function DUF81  26.92 
 
 		 254 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0451006 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2377  hypothetical protein  27.16 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.191266  normal  0.04733 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0562  hypothetical protein  32.59 
 
 		 244 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.826823  normal  0.284673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4656  hypothetical protein  30.94 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3174  hypothetical protein  31.86 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.997879  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2668  hypothetical protein  26.89 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.161838 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1586  hypothetical protein  30.49 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0323601  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3181  hypothetical protein  29.27 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4297  hypothetical protein  29.58 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.147725  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0057  hypothetical protein  29.58 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1831  hypothetical protein  28.5 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.15734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0061  protein of unknown function DUF81  30 
 
 		 245 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0062  hypothetical protein  29.17 
 
 		 245 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33836  hitchhiker  0.00207124 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2832  hypothetical protein  34.24 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4207  hypothetical protein  27.43 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.365939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1099  putative integral membrane protein  31.39 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0060  hypothetical protein  29.17 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.128142  decreased coverage  0.0000000546938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0058  hypothetical protein  29.17 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.101674  hitchhiker  0.000370653 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0062  hypothetical protein  29.17 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000018824 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2637  hypothetical protein  25.31 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00351538  hitchhiker  0.00000000166181 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0669  hypothetical protein  28.77 
 
 		 253 aa  72.4  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1234  hypothetical protein  33.18 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.197  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50390  DUF81 family membrane protein  32.91 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.599192  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3625  hypothetical protein  30.54 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0627  hypothetical protein  28.3 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0530  hypothetical protein  28.45 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4312  hypothetical protein  29.65 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0969  putative integral membrane protein  26.46 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3774  hypothetical protein  25.89 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4415  protein of unknown function DUF81  29.71 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201945  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7709  hypothetical protein  26.88 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.858783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2629  hypothetical protein  27.35 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0081  hypothetical protein  27.03 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1204  protein of unknown function DUF81  26.7 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.361108  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6161  hypothetical protein  27.98 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5796  hypothetical protein  27.98 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6641  hypothetical protein  27.98 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.803889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5183  protein of unknown function DUF81  24.31 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.318212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0205  protein of unknown function DUF81  25.77 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.670843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1342  hypothetical protein  29.22 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0977  hypothetical protein  26.52 
 
 		 244 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000649549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2748  hypothetical protein  21.47 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1552  hypothetical protein  22.57 
 
 		 344 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000152222  normal  0.0331347 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4043  hypothetical protein  33.65 
 
 		 244 aa  42.4  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5325  hypothetical membrane protein  25.66 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0050  hypothetical protein  26.06 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.113555 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  25.12 
 
 		 249 aa  42  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3223  hypothetical protein  29.49 
 
 		 253 aa  42  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000006749  normal  0.26431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>