171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3780 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  626  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  51.53 
 
 
317 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  47.52 
 
 
307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  47.1 
 
 
325 aa  212  7e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  39.75 
 
 
323 aa  181  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  38.37 
 
 
256 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  37.84 
 
 
260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  37.97 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  40.93 
 
 
329 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  36.43 
 
 
253 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  33.86 
 
 
309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  38.58 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  34.5 
 
 
257 aa  137  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  40.31 
 
 
262 aa  135  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  38.31 
 
 
309 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  39.15 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  36.48 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  39.15 
 
 
264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  39.15 
 
 
262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  39.15 
 
 
262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  39.15 
 
 
262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  39.15 
 
 
262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  38.76 
 
 
262 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  34.63 
 
 
261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  37.05 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  35.89 
 
 
257 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  35.46 
 
 
255 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  33.73 
 
 
257 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  39.69 
 
 
264 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  36.86 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  35.97 
 
 
261 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  38.7 
 
 
262 aa  126  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  38.76 
 
 
262 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  34.22 
 
 
253 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  38.76 
 
 
262 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  38.76 
 
 
262 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  37.61 
 
 
261 aa  122  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  37.26 
 
 
261 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  41.7 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  34.22 
 
 
257 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  36.88 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  36.22 
 
 
261 aa  119  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  39.61 
 
 
262 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  33.61 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  35.52 
 
 
266 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  37.84 
 
 
260 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  37.16 
 
 
261 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  36.92 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  38.31 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  35.14 
 
 
257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  38.31 
 
 
262 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  35.74 
 
 
267 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  35.59 
 
 
257 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  34.92 
 
 
263 aa  108  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  38.76 
 
 
262 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  34.23 
 
 
257 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  38.76 
 
 
262 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  38.76 
 
 
262 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  32.39 
 
 
263 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  35.74 
 
 
263 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  36.45 
 
 
262 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  36.7 
 
 
262 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  31.28 
 
 
250 aa  97.8  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  34.16 
 
 
263 aa  92.8  7e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  34.78 
 
 
262 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  33.2 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  31.91 
 
 
263 aa  87.4  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  34.07 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  50 
 
 
119 aa  77  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0479  protein of unknown function DUF81  38.94 
 
 
131 aa  71.6  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  35.91 
 
 
249 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  27.91 
 
 
254 aa  63.5  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3359  hypothetical protein  26.36 
 
 
251 aa  62.4  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  27.31 
 
 
273 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  27.27 
 
 
268 aa  59.3  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  27.44 
 
 
277 aa  58.9  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  26.04 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  27.88 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  28.04 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  31.32 
 
 
296 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  27.27 
 
 
268 aa  57  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  31.32 
 
 
305 aa  56.6  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  28.62 
 
 
260 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2148  hypothetical protein  28.18 
 
 
343 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  28.32 
 
 
263 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  36.72 
 
 
286 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  26.55 
 
 
304 aa  54.3  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  28.14 
 
 
244 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3781  permease  25 
 
 
251 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  28.1 
 
 
274 aa  53.1  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  26.34 
 
 
268 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  26.34 
 
 
264 aa  53.1  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  32.43 
 
 
260 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7258  protein of unknown function DUF81  23.37 
 
 
263 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  28.41 
 
 
420 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  29.21 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1533  permease  24.43 
 
 
251 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  29.12 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  36.17 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>