162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2230 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 257 aa  489  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  87.55 
 
 		 253 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  95.33 
 
 		 257 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  78.21 
 
 		 257 aa  347  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  77.43 
 
 		 257 aa  347  2e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  63.24 
 
 		 264 aa  285  7e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  49.43 
 
 		 255 aa  231  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  51.56 
 
 		 266 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  50.38 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  47.53 
 
 		 289 aa  210  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  46.12 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  51.97 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  53.12 
 
 		 262 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  53.61 
 
 		 264 aa  205  5e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  52.57 
 
 		 262 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  53.52 
 
 		 262 aa  205  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  53.52 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  52.57 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  53.52 
 
 		 262 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  52.57 
 
 		 262 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  52.57 
 
 		 262 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  52.57 
 
 		 262 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  52.57 
 
 		 262 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  52.57 
 
 		 262 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  51.75 
 
 		 262 aa  202  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  45.42 
 
 		 261 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  43.2 
 
 		 253 aa  198  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  50.78 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  46.88 
 
 		 261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  51.17 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  46.88 
 
 		 261 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  46.09 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  46.09 
 
 		 261 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  44.24 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  44.66 
 
 		 260 aa  192  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  44.31 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  45.35 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  49.61 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  43.59 
 
 		 260 aa  188  5.999999999999999e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  43.53 
 
 		 266 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  49.21 
 
 		 261 aa  188  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  50.39 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  48.22 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  47.88 
 
 		 264 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  51.95 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  51.95 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  51.95 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  45.19 
 
 		 263 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  42.59 
 
 		 261 aa  165  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  42.19 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  35.52 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  40.25 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  35.89 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  35.16 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  38.49 
 
 		 317 aa  152  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  38.58 
 
 		 325 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  42.06 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  36.86 
 
 		 309 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  43.53 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  36.22 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  36.36 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0479  protein of unknown function DUF81  65.81 
 
 		 131 aa  132  7.999999999999999e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  36.25 
 
 		 307 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  60.78 
 
 		 119 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  34.13 
 
 		 323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  33.85 
 
 		 263 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  40.38 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  32.93 
 
 		 250 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  38.27 
 
 		 309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  32.82 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  34.25 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  25.09 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  28.24 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  38.37 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  38.37 
 
 		 275 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  31.39 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  29.41 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  31.39 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  26.54 
 
 		 263 aa  59.3  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  44.44 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  24.91 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  27.01 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  28.69 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  27.48 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  25.83 
 
 		 298 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  27.38 
 
 		 260 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  25.94 
 
 		 305 aa  52.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  27.17 
 
 		 304 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  29.72 
 
 		 330 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  26.46 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  28.15 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  40.68 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  29.92 
 
 		 306 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  23.83 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  27.76 
 
 		 260 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2201  hypothetical protein  25.65 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000468231  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  38.37 
 
 		 415 aa  49.3  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  25.39 
 
 		 263 aa  48.9  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  31.86 
 
 		 260 aa  48.9  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  36.99 
 
 		 415 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>