113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_18800 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  100 
 
 
323 aa  615  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  48.5 
 
 
329 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  45.25 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  45.91 
 
 
317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  46.48 
 
 
307 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  39.75 
 
 
332 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  37.8 
 
 
309 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  34.36 
 
 
261 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  33.85 
 
 
260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  36.68 
 
 
264 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  31.03 
 
 
257 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  31.35 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  34.57 
 
 
266 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  34.48 
 
 
261 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  35.38 
 
 
255 aa  124  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  33.58 
 
 
261 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  35.34 
 
 
261 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  34.87 
 
 
260 aa  122  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  34.48 
 
 
261 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  29.01 
 
 
257 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  34.1 
 
 
261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  33.99 
 
 
263 aa  120  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  36.4 
 
 
266 aa  119  7.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  35.94 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  35.71 
 
 
260 aa  116  5e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  32.02 
 
 
253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  34.09 
 
 
289 aa  113  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  33.59 
 
 
256 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  34.18 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  35.54 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  32.49 
 
 
257 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  35.54 
 
 
262 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  35.54 
 
 
262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  35.54 
 
 
262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  35.54 
 
 
262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  35.54 
 
 
262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  35.54 
 
 
264 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  35.15 
 
 
261 aa  109  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  32.49 
 
 
253 aa  109  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  33.94 
 
 
266 aa  109  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  35.04 
 
 
263 aa  108  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  35.12 
 
 
262 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  32.27 
 
 
261 aa  106  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  33.6 
 
 
264 aa  105  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  36.97 
 
 
263 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  32.23 
 
 
269 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  31.22 
 
 
257 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  34.58 
 
 
264 aa  99.8  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  33.73 
 
 
262 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  34.31 
 
 
262 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  33.89 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  34.31 
 
 
262 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  34.73 
 
 
262 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  34.71 
 
 
262 aa  94  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  30.68 
 
 
267 aa  93.2  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  31.28 
 
 
257 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  34.85 
 
 
262 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  35 
 
 
262 aa  89  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  28.57 
 
 
250 aa  82.4  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  35 
 
 
262 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  34.31 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  34.31 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  34.31 
 
 
262 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  33.04 
 
 
263 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  34.21 
 
 
256 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  31.12 
 
 
263 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  27.82 
 
 
263 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  27.74 
 
 
305 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  27.74 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  31.79 
 
 
307 aa  63.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  41.76 
 
 
119 aa  62.4  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  30.08 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0479  protein of unknown function DUF81  37.74 
 
 
131 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  29.67 
 
 
306 aa  59.7  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  28.62 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  28.72 
 
 
315 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  28.97 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  28.01 
 
 
304 aa  56.6  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  29.43 
 
 
420 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  29.84 
 
 
307 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  27.76 
 
 
415 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  28.46 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  28.02 
 
 
308 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  31.94 
 
 
249 aa  52.8  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  30.71 
 
 
343 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  29.27 
 
 
306 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  27.05 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  25.94 
 
 
394 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  28.84 
 
 
443 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  27.13 
 
 
330 aa  50.8  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  28.09 
 
 
307 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  26.97 
 
 
310 aa  50.4  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  26.42 
 
 
320 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  27.17 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  28.14 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  41.18 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  26.59 
 
 
426 aa  47.4  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  27.01 
 
 
360 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  28 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>