154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2414 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  487  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  87.4 
 
 
262 aa  376  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  86.64 
 
 
262 aa  374  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  77.86 
 
 
262 aa  334  9e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  77.86 
 
 
262 aa  333  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  77.1 
 
 
262 aa  331  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  73.66 
 
 
262 aa  330  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  73.48 
 
 
264 aa  329  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  76.72 
 
 
262 aa  329  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  73.66 
 
 
262 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  73.66 
 
 
262 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  73.28 
 
 
262 aa  325  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  73.28 
 
 
262 aa  325  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  73.28 
 
 
262 aa  325  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  73.28 
 
 
262 aa  325  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  77.86 
 
 
262 aa  314  8e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  77.48 
 
 
262 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  77.48 
 
 
262 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  60.85 
 
 
260 aa  277  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  59.3 
 
 
266 aa  258  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  59.52 
 
 
261 aa  237  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  52.4 
 
 
261 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  52.17 
 
 
256 aa  227  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  58.98 
 
 
262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  52.57 
 
 
266 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  54.33 
 
 
261 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  54.33 
 
 
261 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  54.72 
 
 
261 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  52.17 
 
 
261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  50.75 
 
 
289 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  50.79 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  58.59 
 
 
262 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  53.75 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  49.13 
 
 
257 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  46.27 
 
 
255 aa  207  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  47.39 
 
 
253 aa  206  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  51.92 
 
 
263 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  43.31 
 
 
253 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  49.14 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  48.71 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  47.35 
 
 
267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  48.66 
 
 
264 aa  194  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  47.86 
 
 
260 aa  193  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  49.14 
 
 
257 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  47.81 
 
 
264 aa  186  2e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  47.41 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  43.58 
 
 
263 aa  179  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  52.51 
 
 
264 aa  178  9e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  48.32 
 
 
263 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  44.88 
 
 
261 aa  175  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  40.46 
 
 
309 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  46.5 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  51.13 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  37.3 
 
 
257 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  37.15 
 
 
257 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  37.2 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  37.9 
 
 
317 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  40.52 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  39.2 
 
 
332 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  36.9 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  41.63 
 
 
269 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  38.89 
 
 
309 aa  132  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  37.45 
 
 
325 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  36.47 
 
 
263 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  37.84 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  36.08 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  36.86 
 
 
329 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  31.5 
 
 
250 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0479  protein of unknown function DUF81  54.95 
 
 
131 aa  102  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  48.51 
 
 
119 aa  86.7  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  30.26 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  28.95 
 
 
305 aa  62.4  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  25.59 
 
 
254 aa  61.2  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  29.53 
 
 
307 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  25.1 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  25.37 
 
 
266 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  27.86 
 
 
296 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  27.86 
 
 
305 aa  57  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  25 
 
 
298 aa  55.5  0.0000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  23.87 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  28.52 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7258  protein of unknown function DUF81  26.4 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  23.87 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2711  protein of unknown function DUF81  29.27 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  23.87 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  23.87 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  27.78 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  28.21 
 
 
260 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  26.49 
 
 
270 aa  52.8  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  26.57 
 
 
268 aa  52.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  27.78 
 
 
306 aa  52.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  28.47 
 
 
272 aa  52.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  27.23 
 
 
299 aa  52.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  26.49 
 
 
273 aa  52.4  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  27.47 
 
 
315 aa  52  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  23.46 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  28.92 
 
 
245 aa  52  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  27.65 
 
 
263 aa  51.6  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  38.33 
 
 
275 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  23.88 
 
 
300 aa  50.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>