132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2139 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
245 aa  471  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  38.4 
 
 
247 aa  143  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  32.62 
 
 
244 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2711  protein of unknown function DUF81  31.22 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  27.98 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2277  protein of unknown function DUF81  31.93 
 
 
259 aa  68.6  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  29.69 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  31.75 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2943  hypothetical protein  26.64 
 
 
266 aa  62.8  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0381677  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  28.18 
 
 
299 aa  58.9  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  26.91 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  25.68 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2780  hypothetical protein  27.19 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.525966  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5416  protein of unknown function DUF81  25.32 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.764981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  28.57 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1225  protein of unknown function DUF81  24.77 
 
 
272 aa  56.2  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  25.59 
 
 
263 aa  55.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  26.83 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  28.37 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2789  hypothetical protein  29.55 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0463907 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  25.31 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  26.64 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4013  hypothetical protein  29.09 
 
 
269 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  25.9 
 
 
257 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2945  hypothetical protein  24.19 
 
 
266 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.75892 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  30.65 
 
 
260 aa  52  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0632  hypothetical protein  25.58 
 
 
272 aa  52  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.818176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  28.64 
 
 
249 aa  52  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1186  hypothetical protein  25.12 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0170417  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  37.5 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1230  hypothetical protein  25.12 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.615784  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1263  hypothetical protein  25.12 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.555704  normal  0.128151 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  27.08 
 
 
254 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0158  protein of unknown function DUF81  25.55 
 
 
265 aa  51.2  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.220431 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  27.11 
 
 
268 aa  50.8  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  26.21 
 
 
254 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  27.64 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3714  hypothetical protein  27.5 
 
 
251 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313517  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  25.71 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2237  hypothetical protein  25.91 
 
 
263 aa  50.1  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.0571856 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2863  hypothetical protein  23.72 
 
 
266 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0601492  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1533  permease  25.13 
 
 
251 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311144 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1153  hypothetical protein  23.47 
 
 
269 aa  49.7  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  25.91 
 
 
266 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  32.58 
 
 
123 aa  49.7  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  37.97 
 
 
119 aa  49.7  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  29.2 
 
 
260 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  28.7 
 
 
267 aa  49.3  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1178  hypothetical protein  22.86 
 
 
272 aa  49.3  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  30.32 
 
 
249 aa  49.3  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2673  hypothetical protein  28.43 
 
 
268 aa  48.9  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  26.59 
 
 
275 aa  49.3  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  28.1 
 
 
255 aa  48.9  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3708  hypothetical protein  27.5 
 
 
251 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4460  hypothetical protein  24.77 
 
 
270 aa  48.5  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  29.91 
 
 
261 aa  48.5  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  22.71 
 
 
257 aa  48.5  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05309  integral membrane transmembrane protein  29.48 
 
 
273 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  23.93 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  26.91 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  26.92 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  26.92 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  26.92 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  30.04 
 
 
260 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  26 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3623  hypothetical protein  24.88 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.900128  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1040  hypothetical protein  25.25 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0054225  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  26 
 
 
260 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00969  hypothetical protein  25 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3781  permease  25.63 
 
 
251 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  26.27 
 
 
261 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  30.95 
 
 
264 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  27.1 
 
 
255 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  30.36 
 
 
267 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1384  hypothetical protein  25.86 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0472922  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  25.5 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  23.77 
 
 
263 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1229  hypothetical protein  23.65 
 
 
264 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.341585  hitchhiker  0.00289815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  26.58 
 
 
286 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  25.38 
 
 
298 aa  45.8  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  25.71 
 
 
265 aa  45.8  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  26 
 
 
260 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  25.1 
 
 
261 aa  45.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  23.45 
 
 
266 aa  45.4  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  26.27 
 
 
261 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0357  hypothetical protein  36.47 
 
 
127 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  27.73 
 
 
266 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  23.4 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  27.01 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  33.33 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001494  hypothetical protein  22.12 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.696729  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  25.86 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  26.25 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  26.25 
 
 
264 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  41.03 
 
 
296 aa  44.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  24.14 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  29.28 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  34.78 
 
 
254 aa  43.9  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  26.45 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  32.04 
 
 
120 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>