206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4028 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
285 aa  534  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  32.44 
 
 
255 aa  92.8  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  27.92 
 
 
258 aa  88.6  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  33.01 
 
 
260 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  30.63 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  31.03 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  30.64 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  27.06 
 
 
249 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3951  hypothetical protein  30.81 
 
 
282 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1616  hypothetical protein  25.81 
 
 
261 aa  60.1  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1947  hypothetical protein  27.57 
 
 
262 aa  59.7  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  30.97 
 
 
123 aa  59.7  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  28.76 
 
 
257 aa  59.7  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  27.62 
 
 
277 aa  59.3  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  28.25 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0391  hypothetical protein  26.15 
 
 
261 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.329397  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  34.33 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  27.94 
 
 
2798 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0873  hypothetical protein  31.09 
 
 
339 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.888548  normal  0.566459 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0367  hypothetical protein  25.35 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  30.53 
 
 
299 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  28.31 
 
 
261 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  30.39 
 
 
291 aa  56.6  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  25.66 
 
 
259 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  26.06 
 
 
242 aa  56.2  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  28.45 
 
 
120 aa  56.2  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  23.83 
 
 
286 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4078  protein of unknown function DUF81  30.87 
 
 
261 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  35.64 
 
 
302 aa  55.5  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  31.4 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4492  protein of unknown function DUF81  24.14 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  31.4 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  23.81 
 
 
265 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  31.2 
 
 
264 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  33.04 
 
 
280 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4428  protein of unknown function DUF81  24.14 
 
 
267 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  31.54 
 
 
268 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  29.76 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  37.14 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  27.75 
 
 
254 aa  53.9  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  24.81 
 
 
300 aa  53.9  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  37.14 
 
 
261 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  23.83 
 
 
255 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2317  protein of unknown function DUF81  22.99 
 
 
265 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  36.19 
 
 
261 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  37.5 
 
 
307 aa  52.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27.71 
 
 
266 aa  52.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  30.43 
 
 
247 aa  52.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  28.14 
 
 
245 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  27.27 
 
 
266 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  29.51 
 
 
276 aa  51.6  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  30.97 
 
 
121 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  23.46 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  38.55 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0268  hypothetical protein  30.36 
 
 
277 aa  50.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02210  hypothetical protein  36.92 
 
 
267 aa  50.8  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  42.11 
 
 
283 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  24.32 
 
 
278 aa  50.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  28.37 
 
 
255 aa  50.4  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  34.92 
 
 
268 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  34 
 
 
310 aa  49.7  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0644  hypothetical protein  29.77 
 
 
276 aa  49.3  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  38.55 
 
 
266 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  38.55 
 
 
266 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  38.55 
 
 
266 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  38.55 
 
 
266 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  38.55 
 
 
266 aa  49.3  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  38.55 
 
 
262 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  38.55 
 
 
262 aa  49.3  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  38.55 
 
 
266 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1682  hypothetical protein  26.2 
 
 
246 aa  49.3  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  38.55 
 
 
139 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  30.91 
 
 
121 aa  48.9  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0121  hypothetical protein  34.65 
 
 
318 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  37.04 
 
 
264 aa  48.9  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  25.91 
 
 
283 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  36.11 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  30 
 
 
275 aa  48.9  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  27.11 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  36.67 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  34.13 
 
 
267 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  27.59 
 
 
254 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004429  hypothetical protein  31.34 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.108567  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  33.33 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  27.34 
 
 
300 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  30.16 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  34.13 
 
 
268 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  36 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4316  hypothetical protein  31.33 
 
 
264 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  24.11 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3310  protein of unknown function DUF81  31.06 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251637  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  24.11 
 
 
275 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  37.8 
 
 
306 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0357  hypothetical protein  37.8 
 
 
127 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  32.08 
 
 
251 aa  47  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  35.35 
 
 
254 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1097  hypothetical protein  26.51 
 
 
262 aa  47.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  41.56 
 
 
307 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  27.73 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>