106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0480 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
119 aa  237  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  88.6 
 
 
264 aa  202  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  65.43 
 
 
257 aa  107  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  62.96 
 
 
257 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  60.49 
 
 
257 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  56.1 
 
 
257 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  67.11 
 
 
262 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  57.5 
 
 
253 aa  94.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  50.48 
 
 
289 aa  95.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  51 
 
 
267 aa  94.7  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  66.67 
 
 
262 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  50.48 
 
 
260 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  48.11 
 
 
266 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  60.81 
 
 
256 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  52.87 
 
 
266 aa  87.8  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  45.28 
 
 
261 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  44.23 
 
 
260 aa  85.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  43.4 
 
 
266 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  43.12 
 
 
261 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  50 
 
 
253 aa  82  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  46.53 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  53.16 
 
 
256 aa  82  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  52.38 
 
 
264 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  46.53 
 
 
261 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  46.53 
 
 
261 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  46.53 
 
 
261 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  54.43 
 
 
309 aa  80.9  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  38.1 
 
 
257 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  50 
 
 
332 aa  77.4  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  45.36 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  50 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  44.05 
 
 
325 aa  75.1  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  58.06 
 
 
264 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  53.75 
 
 
261 aa  74.3  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  37.89 
 
 
257 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  44.32 
 
 
307 aa  71.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  33.94 
 
 
257 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  46.43 
 
 
261 aa  72  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  50.62 
 
 
260 aa  68.2  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  49.02 
 
 
262 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  49.02 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  49.02 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  49.02 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  49.02 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  49.02 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  49.02 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  49.02 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  42.86 
 
 
262 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  37.11 
 
 
317 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  49.04 
 
 
262 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  45.68 
 
 
263 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  50 
 
 
262 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  48.08 
 
 
262 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  48.04 
 
 
262 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  56.96 
 
 
262 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  53.49 
 
 
262 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  47.12 
 
 
262 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  54.24 
 
 
262 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  41.76 
 
 
323 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  54.24 
 
 
262 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  54.24 
 
 
262 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  47.57 
 
 
263 aa  60.8  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  46.58 
 
 
263 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  41.18 
 
 
263 aa  57  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  43.84 
 
 
263 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  34.07 
 
 
263 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  33.33 
 
 
250 aa  55.1  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  38.36 
 
 
275 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  38.36 
 
 
275 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  39.68 
 
 
275 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  42.31 
 
 
329 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  37.97 
 
 
245 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  29.79 
 
 
269 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  41.1 
 
 
415 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  38.27 
 
 
268 aa  48.9  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  47.89 
 
 
305 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  47.89 
 
 
296 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  38.16 
 
 
415 aa  48.1  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  40.74 
 
 
273 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  40.62 
 
 
251 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  39.73 
 
 
415 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  35.8 
 
 
268 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  34.09 
 
 
269 aa  46.2  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  35.56 
 
 
307 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  38.67 
 
 
443 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  35.51 
 
 
298 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  38.89 
 
 
346 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  39.73 
 
 
420 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0509  hypothetical protein  39.44 
 
 
260 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  34.58 
 
 
274 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0248  hypothetical protein  38.33 
 
 
254 aa  43.9  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  36.62 
 
 
2798 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  37.04 
 
 
263 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  34.57 
 
 
270 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  34.18 
 
 
268 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  34.18 
 
 
264 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  37.84 
 
 
249 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  36.84 
 
 
427 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  40.58 
 
 
249 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>