112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8588 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  599  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  65.45 
 
 
325 aa  338  7e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  57.36 
 
 
307 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  51.53 
 
 
332 aa  238  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  45.91 
 
 
323 aa  204  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  38.46 
 
 
260 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  35.43 
 
 
309 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  33.47 
 
 
253 aa  149  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  43.41 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  38.2 
 
 
264 aa  143  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  37.8 
 
 
289 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  39.06 
 
 
262 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  39.22 
 
 
264 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  39.06 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  37.25 
 
 
263 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  39.06 
 
 
262 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  39.06 
 
 
262 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  39.06 
 
 
262 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  39.06 
 
 
262 aa  139  7e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  37.93 
 
 
260 aa  139  7e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  40.75 
 
 
266 aa  139  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  34.43 
 
 
257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  39.84 
 
 
262 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  35.42 
 
 
257 aa  135  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  39.73 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  36.65 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  37.02 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  33.46 
 
 
255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  34.02 
 
 
257 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  35.14 
 
 
261 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  36.6 
 
 
253 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  36.69 
 
 
261 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  36.61 
 
 
266 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  36.59 
 
 
261 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  36.59 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  36.18 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  35.55 
 
 
261 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  34.91 
 
 
263 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  39.84 
 
 
262 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  39.84 
 
 
262 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  37.61 
 
 
257 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  39.84 
 
 
262 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  37.34 
 
 
257 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  39.84 
 
 
262 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  34.94 
 
 
266 aa  122  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  34.33 
 
 
260 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  37.34 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  36.32 
 
 
264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  37.12 
 
 
267 aa  119  6e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  36.64 
 
 
263 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  34.96 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  37.9 
 
 
262 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  33.61 
 
 
269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  37.02 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  37.34 
 
 
264 aa  112  9e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  38.78 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  38.65 
 
 
262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  39.04 
 
 
262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  39.44 
 
 
262 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  38.49 
 
 
262 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  31.75 
 
 
250 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  33.75 
 
 
263 aa  103  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  37.07 
 
 
262 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  37.39 
 
 
256 aa  98.6  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  36.05 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  36.64 
 
 
262 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  36.64 
 
 
262 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  30.42 
 
 
263 aa  86.7  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0479  protein of unknown function DUF81  38.05 
 
 
131 aa  65.1  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  37.11 
 
 
119 aa  65.1  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  27.99 
 
 
305 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  27.99 
 
 
296 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  30.08 
 
 
307 aa  60.5  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  22.67 
 
 
254 aa  58.5  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  26.22 
 
 
315 aa  58.5  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  27.13 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  26.52 
 
 
310 aa  55.8  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  26.52 
 
 
306 aa  55.8  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  25.25 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  26.02 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2327  hypothetical protein  25.37 
 
 
249 aa  53.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0207977  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  25 
 
 
305 aa  53.1  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  25.56 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  26.97 
 
 
304 aa  51.6  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  24.68 
 
 
255 aa  51.6  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  26.02 
 
 
308 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  31.88 
 
 
249 aa  50.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  35.29 
 
 
275 aa  50.1  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  35.29 
 
 
275 aa  50.1  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  26.79 
 
 
2798 aa  49.7  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3428  permease  25.45 
 
 
251 aa  49.3  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.392516  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  23.97 
 
 
304 aa  49.3  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1533  permease  23.92 
 
 
251 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311144 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3714  hypothetical protein  25.35 
 
 
251 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313517  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  42.03 
 
 
275 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  26.27 
 
 
306 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3708  hypothetical protein  24.31 
 
 
251 aa  47  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3379  permease  26.51 
 
 
245 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3781  permease  22.97 
 
 
251 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3690  hypothetical protein  25.47 
 
 
267 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.113603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>