70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0479 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0479  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 131 aa  250  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  86.32 
 
 		 264 aa  156  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  71.05 
 
 		 257 aa  153  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  71.19 
 
 		 257 aa  153  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  65.81 
 
 		 257 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  63.56 
 
 		 253 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  66.33 
 
 		 257 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  53.51 
 
 		 262 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  53.1 
 
 		 263 aa  111  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  53.51 
 
 		 262 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  53.51 
 
 		 262 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  53.51 
 
 		 262 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  53.51 
 
 		 262 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  53.51 
 
 		 262 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  53.51 
 
 		 264 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  53.51 
 
 		 262 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  56.25 
 
 		 289 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  51.35 
 
 		 255 aa  106  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  49.12 
 
 		 261 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  43.08 
 
 		 256 aa  103  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  54.95 
 
 		 262 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  50.45 
 
 		 260 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  52.94 
 
 		 264 aa  101  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  51.79 
 
 		 260 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  50.93 
 
 		 263 aa  100  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  53.15 
 
 		 266 aa  100  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  55.36 
 
 		 262 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  55.36 
 
 		 262 aa  100  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  54.46 
 
 		 262 aa  100  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  44.76 
 
 		 253 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  53.57 
 
 		 262 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  50 
 
 		 263 aa  97.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  45.61 
 
 		 261 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  50.86 
 
 		 261 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  46.4 
 
 		 267 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  47.54 
 
 		 266 aa  94.7  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  50 
 
 		 261 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  54.05 
 
 		 262 aa  93.6  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  48.65 
 
 		 263 aa  93.6  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  49.14 
 
 		 261 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  43.48 
 
 		 266 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  53.15 
 
 		 262 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  42.74 
 
 		 260 aa  91.3  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  43.48 
 
 		 261 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  48.28 
 
 		 261 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  40.31 
 
 		 262 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  45.54 
 
 		 262 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  48.18 
 
 		 261 aa  83.6  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  53.57 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  53.57 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  43.08 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  53.57 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  38.74 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  38.74 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  41.59 
 
 		 309 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  39.09 
 
 		 317 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  41.67 
 
 		 332 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  33.61 
 
 		 307 aa  73.6  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  41.76 
 
 		 325 aa  73.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  47.62 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  37.74 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  36.94 
 
 		 257 aa  67  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  41.28 
 
 		 262 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  34.17 
 
 		 263 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  37.84 
 
 		 269 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  33.06 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  29.29 
 
 		 329 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  32.32 
 
 		 309 aa  54.7  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  30.97 
 
 		 250 aa  54.3  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  37.27 
 
 		 249 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>