122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4206 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  626  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  48.5 
 
 
323 aa  270  2e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  45.35 
 
 
325 aa  176  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  43.41 
 
 
317 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  39.84 
 
 
266 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  40.93 
 
 
332 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  34.88 
 
 
261 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  35.32 
 
 
260 aa  146  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  36.61 
 
 
261 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  41.5 
 
 
307 aa  143  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  38.19 
 
 
309 aa  142  6e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  35.86 
 
 
266 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  37.13 
 
 
256 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  35.41 
 
 
257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  36.82 
 
 
260 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  33.85 
 
 
257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  35.39 
 
 
260 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  35.63 
 
 
264 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  34.4 
 
 
263 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  34.54 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  32.56 
 
 
253 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  38.34 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  32.81 
 
 
261 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  37.65 
 
 
262 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  34.88 
 
 
261 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  32.81 
 
 
261 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  37.65 
 
 
262 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  37.25 
 
 
264 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  37.25 
 
 
262 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  37.25 
 
 
262 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  37.25 
 
 
262 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  37.25 
 
 
262 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  33.88 
 
 
261 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  34.63 
 
 
289 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  33.85 
 
 
255 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  35.36 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  35.38 
 
 
267 aa  112  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  37.05 
 
 
262 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  38.67 
 
 
262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  36.65 
 
 
262 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  36.65 
 
 
262 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  32.67 
 
 
263 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  32.82 
 
 
263 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  31.25 
 
 
253 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  31.25 
 
 
257 aa  106  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  30.36 
 
 
250 aa  105  8e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  36.33 
 
 
269 aa  105  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  39.29 
 
 
262 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  37.45 
 
 
262 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  34.75 
 
 
261 aa  104  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  33.97 
 
 
266 aa  103  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  37.05 
 
 
262 aa  102  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  36.86 
 
 
262 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  33.2 
 
 
261 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  38.34 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  30.42 
 
 
257 aa  97.1  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  29.58 
 
 
257 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  33.08 
 
 
264 aa  95.5  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  35.47 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  35.9 
 
 
262 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  35.9 
 
 
262 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  34.17 
 
 
264 aa  94.7  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  35.9 
 
 
262 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  29.06 
 
 
257 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  34.21 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  34.62 
 
 
263 aa  88.2  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  36.16 
 
 
256 aa  85.9  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  32.07 
 
 
262 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  28.14 
 
 
315 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  26.02 
 
 
427 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  25.48 
 
 
255 aa  54.3  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  28.36 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  26.8 
 
 
420 aa  52.8  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  31.14 
 
 
244 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  27.88 
 
 
308 aa  52.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  27.08 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  29.28 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  28.35 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0183  protein of unknown function DUF81  26.27 
 
 
253 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.699448  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  24.86 
 
 
426 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  29.86 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  26.71 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  29.86 
 
 
296 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  24.45 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  23.61 
 
 
304 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  29.82 
 
 
286 aa  50.4  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  25.93 
 
 
428 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  42.31 
 
 
119 aa  50.4  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0479  protein of unknown function DUF81  30.08 
 
 
131 aa  50.1  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  26.09 
 
 
265 aa  50.1  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  32.47 
 
 
254 aa  49.7  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  29.5 
 
 
307 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  30.86 
 
 
249 aa  49.7  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  32.1 
 
 
254 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  24.56 
 
 
304 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  27.8 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  29.21 
 
 
308 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  28.1 
 
 
320 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  26.01 
 
 
443 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  30.72 
 
 
254 aa  46.6  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>