161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4222 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  501  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  96.17 
 
 		 266 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  83.52 
 
 		 261 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  75.48 
 
 		 261 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  75.48 
 
 		 261 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  75.48 
 
 		 261 aa  359  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  74.71 
 
 		 261 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  63.67 
 
 		 260 aa  299  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  60.24 
 
 		 260 aa  275  7e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  53.73 
 
 		 266 aa  236  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  54.3 
 
 		 260 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  46.67 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  47.49 
 
 		 289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  45.82 
 
 		 256 aa  208  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  51.78 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  51.38 
 
 		 262 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  51.38 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  51.38 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  51.38 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  51.38 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  51.38 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  51.38 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  51.75 
 
 		 262 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  54.15 
 
 		 264 aa  195  6e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  49.24 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  50.97 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  50.97 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  50.58 
 
 		 262 aa  192  4e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  52.17 
 
 		 262 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  44.14 
 
 		 255 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  45.98 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  47.26 
 
 		 261 aa  183  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  51.38 
 
 		 262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  50.99 
 
 		 262 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  46.64 
 
 		 264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  51.05 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  51.05 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  50.63 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  46.64 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  48.25 
 
 		 263 aa  175  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  46.88 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  43.29 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  43.75 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  42.98 
 
 		 264 aa  171  6.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  46.25 
 
 		 262 aa  171  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  41.99 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  38.58 
 
 		 257 aa  169  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  45.14 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  43.67 
 
 		 263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  38.55 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  42.86 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  40.26 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  38.65 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  41.13 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  38.49 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  45.81 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  37.9 
 
 		 317 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  40.09 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  35.43 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  37.8 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  33.58 
 
 		 323 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  39.04 
 
 		 309 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  35.89 
 
 		 332 aa  123  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  33.73 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  37.25 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  35.06 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  30.59 
 
 		 263 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  28.97 
 
 		 250 aa  89.4  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  45.28 
 
 		 119 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0479  protein of unknown function DUF81  43.48 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  28.52 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  27.67 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  29.23 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  28.85 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  28.85 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  27.69 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  27.55 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  30.33 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  27.48 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  26.87 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  28.1 
 
 		 296 aa  62.4  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  28.1 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  26.92 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  29.37 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  27.31 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  28.97 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  26.87 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  26.29 
 
 		 306 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  27.53 
 
 		 330 aa  57  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1128  membrane protein  26.92 
 
 		 256 aa  57  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.24374  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  27.57 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  24.8 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  26.33 
 
 		 304 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  27.76 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  24.03 
 
 		 307 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  40.96 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  24.03 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  28.57 
 
 		 307 aa  52.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  26.29 
 
 		 300 aa  52.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  25.48 
 
 		 266 aa  52.8  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>