142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4384 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  506  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  47.49 
 
 		 255 aa  205  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  49.22 
 
 		 261 aa  202  4e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  50.96 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  49.43 
 
 		 266 aa  195  8.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  52.55 
 
 		 261 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  51.76 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  51.37 
 
 		 261 aa  188  7e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  51.31 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  51.37 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  50.56 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  51.69 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  51.31 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  51.31 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  51.31 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  51.31 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  51.52 
 
 		 264 aa  186  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  47.84 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  43.2 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  47.83 
 
 		 261 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  51.14 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  47.13 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  50.76 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  47.45 
 
 		 266 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  51.14 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  51.14 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  48.06 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  52.04 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  45.17 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  48.25 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  43.14 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  48.66 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  44.77 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  45.61 
 
 		 257 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  46.61 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  46.27 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  48.85 
 
 		 262 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  52.42 
 
 		 262 aa  168  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  49.23 
 
 		 262 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  47.53 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  44.7 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  50.38 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  51.52 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  51.52 
 
 		 262 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  51.52 
 
 		 262 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  42.55 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  39.77 
 
 		 325 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  43.22 
 
 		 257 aa  159  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  43.73 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  45.7 
 
 		 261 aa  156  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  46.33 
 
 		 262 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  39.7 
 
 		 317 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  37.8 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  46.44 
 
 		 257 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  45.42 
 
 		 263 aa  152  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  36.51 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  36.55 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  44.81 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  40.23 
 
 		 307 aa  145  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  43.21 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  37.84 
 
 		 323 aa  145  9e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  39.3 
 
 		 332 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  37.69 
 
 		 329 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  46.26 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  34.13 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  39.69 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  36.58 
 
 		 263 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  31.37 
 
 		 250 aa  108  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0479  protein of unknown function DUF81  43.85 
 
 		 131 aa  92.4  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  52.38 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  35.02 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  31.32 
 
 		 305 aa  63.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  31.32 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  31.13 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  25.83 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  26.98 
 
 		 304 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  27.52 
 
 		 307 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  26.09 
 
 		 330 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  26.98 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  26.26 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  27.13 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  25.86 
 
 		 310 aa  50.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  26.46 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  25 
 
 		 268 aa  50.1  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  25.29 
 
 		 257 aa  50.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  27.41 
 
 		 307 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  24.34 
 
 		 273 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  25.7 
 
 		 307 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  25.31 
 
 		 305 aa  48.9  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  37.04 
 
 		 285 aa  48.9  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  25.09 
 
 		 267 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  45.07 
 
 		 343 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  31.12 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  25.7 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  25.9 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  27.03 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  27.92 
 
 		 313 aa  47.4  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  24.81 
 
 		 298 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  27.19 
 
 		 265 aa  47.4  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  24.21 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>