148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2426 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2426  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  501  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2340  hypothetical protein  84.79 
 
 
263 aa  367  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2455  hypothetical protein  73.38 
 
 
263 aa  331  6e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.900175  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3052  hypothetical protein  65.92 
 
 
267 aa  305  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.291643  normal  0.0745298 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  52.11 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  48.06 
 
 
261 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  49.23 
 
 
255 aa  216  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  49.24 
 
 
266 aa  214  9e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  48.44 
 
 
261 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1670  hypothetical protein  46.95 
 
 
289 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.020684  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  50.39 
 
 
261 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  48.83 
 
 
266 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  50.39 
 
 
261 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  50.39 
 
 
261 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  47.51 
 
 
260 aa  207  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  49.61 
 
 
261 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3426  hypothetical protein  46.94 
 
 
260 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0003511 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  44.75 
 
 
256 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  46.97 
 
 
266 aa  188  5.999999999999999e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  44.96 
 
 
253 aa  188  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1422  hypothetical protein  49.25 
 
 
262 aa  188  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0737  hypothetical protein  50.77 
 
 
262 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.277239 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0720  hypothetical protein  50.77 
 
 
262 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2543  hypothetical protein  51.15 
 
 
262 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.326102 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3934  hypothetical protein  50.77 
 
 
262 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343133 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1111  hypothetical protein  49.23 
 
 
264 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0105598  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3143  hypothetical protein  49.07 
 
 
262 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3180  hypothetical protein  48.7 
 
 
262 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2024  hypothetical protein  48.7 
 
 
264 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3196  permease  48.7 
 
 
262 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.95618  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0889  hypothetical protein  48.7 
 
 
262 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.703742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2722  hypothetical protein  48.7 
 
 
262 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1887  hypothetical protein  48.7 
 
 
262 aa  180  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.220438  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2414  hypothetical protein  47.37 
 
 
262 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0802  protein of unknown function DUF81  50.38 
 
 
262 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.889936 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3878  hypothetical protein  50.77 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1361  protein of unknown function DUF81  46.86 
 
 
261 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4384  hypothetical protein  46.18 
 
 
264 aa  171  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2783  hypothetical protein  43.24 
 
 
263 aa  167  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000836619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  46.92 
 
 
262 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  39.33 
 
 
257 aa  165  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  40.59 
 
 
253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0361  hypothetical protein  50.21 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175029  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0844  hypothetical protein  50.21 
 
 
262 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22906  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0816  hypothetical protein  48.56 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.31519  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  43.41 
 
 
264 aa  160  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  46.15 
 
 
262 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2697  hypothetical protein  40.66 
 
 
257 aa  159  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  40 
 
 
257 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  43.46 
 
 
261 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  34.88 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2253  hypothetical protein  45.76 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2690  protein of unknown function DUF81  38.91 
 
 
257 aa  143  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  34.4 
 
 
257 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  31.78 
 
 
257 aa  139  6e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  38.19 
 
 
309 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2422  protein of unknown function DUF81  38.98 
 
 
262 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  33.84 
 
 
317 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  37.26 
 
 
309 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  34.72 
 
 
325 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  36.6 
 
 
332 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0968  hypothetical protein  36.82 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  31.87 
 
 
263 aa  115  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  32.7 
 
 
323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4206  hypothetical protein  34.21 
 
 
329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2843  protein of unknown function DUF81  32.03 
 
 
263 aa  108  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0445447  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4693  hypothetical protein  31.08 
 
 
250 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0114145  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  31.89 
 
 
307 aa  102  7e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0479  protein of unknown function DUF81  48.65 
 
 
131 aa  85.9  6e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  51.06 
 
 
119 aa  84.7  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0855  hypothetical protein  36.11 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  25.46 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  39.13 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  39.13 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  25.65 
 
 
275 aa  56.2  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  28.18 
 
 
307 aa  55.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  26.2 
 
 
266 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  26.2 
 
 
266 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  24.9 
 
 
262 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  24.9 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  26.09 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  26.2 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  26.2 
 
 
266 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  26.37 
 
 
266 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  26.2 
 
 
266 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  30.45 
 
 
245 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  25.11 
 
 
254 aa  52.4  0.000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  25.68 
 
 
300 aa  52.4  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  41.79 
 
 
275 aa  52  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  41.79 
 
 
275 aa  52  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  24.66 
 
 
268 aa  51.6  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  26.01 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  25.28 
 
 
300 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  25.59 
 
 
307 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  47.37 
 
 
275 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7258  protein of unknown function DUF81  23.6 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  24.82 
 
 
267 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  23.35 
 
 
277 aa  49.7  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  25.27 
 
 
260 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  25.26 
 
 
266 aa  48.9  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>