190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7258 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_7258  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
263 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  36.96 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  25.28 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1097  hypothetical protein  26.69 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5026  hypothetical protein  27.19 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908979  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  27.13 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  24.7 
 
 
264 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1512  hypothetical protein  28.51 
 
 
257 aa  62.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  27.32 
 
 
275 aa  62.4  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  27.32 
 
 
275 aa  62.4  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2911  hypothetical protein  26.25 
 
 
266 aa  62  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266623 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  26.12 
 
 
266 aa  62  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1617  hypothetical protein  23.58 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.449373  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1628  hypothetical protein  23.58 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2726  protein of unknown function DUF81  23.58 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.90408  hitchhiker  0.000647334 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1651  hypothetical protein  23.58 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.4425 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  26.53 
 
 
257 aa  59.7  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  25.51 
 
 
267 aa  59.3  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  25.6 
 
 
264 aa  59.3  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0226  hypothetical protein  24.69 
 
 
252 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.94047  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1957  hypothetical protein  29.6 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2888  protein of unknown function DUF81  25.9 
 
 
260 aa  58.2  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  23.77 
 
 
274 aa  57  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2997  hypothetical protein  24.6 
 
 
251 aa  56.6  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.504173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0799  protein of unknown function DUF81  23.9 
 
 
260 aa  56.2  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  26.48 
 
 
261 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  25.93 
 
 
275 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  27.07 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2471  hypothetical protein  27.02 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  27.82 
 
 
286 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  23.41 
 
 
269 aa  54.7  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  22.67 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  24.02 
 
 
261 aa  53.5  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2631  hypothetical protein  26.61 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352704 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2484  hypothetical protein  24.71 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1818  hypothetical protein  25.81 
 
 
257 aa  53.1  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2539  hypothetical protein  27.02 
 
 
257 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.52018  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  24.44 
 
 
300 aa  52.8  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  25.69 
 
 
261 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  22.78 
 
 
276 aa  52.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  23.24 
 
 
268 aa  52.4  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  23.62 
 
 
253 aa  52.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  23.17 
 
 
308 aa  52.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  25.97 
 
 
265 aa  52.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1420  protein of unknown function DUF81  26.78 
 
 
264 aa  52  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  23.35 
 
 
320 aa  52  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  25.69 
 
 
261 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  25.68 
 
 
309 aa  52  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  23.51 
 
 
256 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3729  hypothetical protein  25.98 
 
 
261 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2430  hypothetical protein  22.9 
 
 
256 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  24.59 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3802  hypothetical protein  23.33 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.0298076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  25.69 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  22.96 
 
 
307 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  23.08 
 
 
283 aa  50.8  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  23.08 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  26.67 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  26.48 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  20.17 
 
 
259 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  26.48 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  26.48 
 
 
291 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  26.57 
 
 
266 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  26.57 
 
 
266 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  23.95 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  23.95 
 
 
251 aa  49.7  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  23.51 
 
 
256 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  25.68 
 
 
262 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  23.51 
 
 
255 aa  49.3  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  27.2 
 
 
332 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  28.25 
 
 
268 aa  48.9  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  23.64 
 
 
307 aa  48.9  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  22.05 
 
 
283 aa  48.9  0.00009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  26.87 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2628  adenylosuccinate synthetase  25.59 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.16831  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  23.51 
 
 
256 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2631  hypothetical protein  23.39 
 
 
257 aa  48.5  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1248  hypothetical protein  25.82 
 
 
257 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112038 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  27.63 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  26.49 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  25 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  26.87 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  26.1 
 
 
261 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  24.07 
 
 
307 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  26.92 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  27.64 
 
 
323 aa  47.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  23.95 
 
 
317 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  25 
 
 
266 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  27.78 
 
 
268 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  29.66 
 
 
267 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  27.78 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  23.51 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0177  hypothetical protein  23.01 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.6858  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  26.49 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  27.46 
 
 
264 aa  47.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  21.96 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  24.53 
 
 
266 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  24.44 
 
 
307 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  22.08 
 
 
257 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  25 
 
 
272 aa  46.6  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.2411 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>