More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1173 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
267 aa  510  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  57.31 
 
 
269 aa  281  8.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  32.7 
 
 
260 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  33.33 
 
 
267 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27.8 
 
 
266 aa  85.9  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  28.52 
 
 
2798 aa  81.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  28.25 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  25.1 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  28.63 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  27.19 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  27.19 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  29.02 
 
 
255 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  27.19 
 
 
266 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  27.19 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  27.19 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  27.19 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  27.19 
 
 
262 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  27.19 
 
 
262 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  26.55 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  29.48 
 
 
283 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  30.8 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  28.3 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  28.3 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  27.95 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  29.04 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  30.2 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  24.3 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  28.09 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  25.71 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  25.71 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  25.94 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  25.94 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  25.94 
 
 
291 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2434  hypothetical protein  27.48 
 
 
265 aa  67  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1197  hypothetical protein  28.06 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0268  hypothetical protein  25.7 
 
 
277 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  29.29 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  29.29 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  29.34 
 
 
301 aa  65.5  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  28.14 
 
 
283 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  29.7 
 
 
283 aa  65.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  26.72 
 
 
275 aa  64.3  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3310  protein of unknown function DUF81  26.27 
 
 
278 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251637  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  27.65 
 
 
260 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  28.57 
 
 
251 aa  63.2  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  29.34 
 
 
258 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  26.57 
 
 
265 aa  62.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  24.25 
 
 
296 aa  62.4  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  27.92 
 
 
257 aa  62.4  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  24.25 
 
 
305 aa  62.4  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  22.86 
 
 
293 aa  62  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2424  protein of unknown function DUF81  43.18 
 
 
261 aa  62  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  25.24 
 
 
275 aa  61.6  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  28.4 
 
 
281 aa  62  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3512  hypothetical protein  26.48 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000688287  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  26.89 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  38.95 
 
 
139 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  25.51 
 
 
277 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  25.45 
 
 
254 aa  60.8  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  35.4 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4771  hypothetical protein  26.54 
 
 
241 aa  60.5  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.838718  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  26.89 
 
 
260 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  28.87 
 
 
299 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  26.69 
 
 
266 aa  59.7  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  26.52 
 
 
260 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  27.9 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  30.52 
 
 
255 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  26.52 
 
 
260 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1556  protein of unknown function DUF81  29.76 
 
 
263 aa  59.7  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  25.28 
 
 
263 aa  58.9  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3869  protein of unknown function DUF81  25.55 
 
 
277 aa  59.3  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0185467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  30.8 
 
 
255 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  27.62 
 
 
291 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  26.86 
 
 
260 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  26.86 
 
 
260 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  25.58 
 
 
270 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  24.8 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0023  hypothetical protein  25.98 
 
 
294 aa  58.5  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2312  putative integral membrane protein  26.89 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2210  protein of unknown function DUF81  22.04 
 
 
276 aa  58.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000833902  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  27.41 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  25.37 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  29.77 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  27.99 
 
 
268 aa  57.8  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  25.97 
 
 
277 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  30.36 
 
 
121 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1225  protein of unknown function DUF81  24.03 
 
 
272 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  25 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  27.1 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8368  protein of unknown function DUF81  25.62 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.154223  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  27.51 
 
 
268 aa  57  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  26.77 
 
 
290 aa  57  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  25.86 
 
 
265 aa  57  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  24.4 
 
 
277 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  26.82 
 
 
271 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  25.58 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2139  protein of unknown function DUF81  27.46 
 
 
245 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0529  hypothetical protein  25.4 
 
 
266 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.276386  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  26.52 
 
 
325 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>