200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3310 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_3310  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
278 aa  538  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251637  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  64.39 
 
 
278 aa  363  1e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3317  hypothetical protein  60.22 
 
 
278 aa  295  6e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3912  hypothetical protein  59.86 
 
 
278 aa  291  8e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0103404  normal  0.04978 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  55 
 
 
280 aa  283  2.0000000000000002e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3785  hypothetical protein  56.12 
 
 
278 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.29044  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  51.42 
 
 
277 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  49.24 
 
 
283 aa  226  3e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  46.72 
 
 
276 aa  225  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3869  protein of unknown function DUF81  48.37 
 
 
277 aa  218  6e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0185467  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0999  protein of unknown function DUF81  47.31 
 
 
286 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0943  hypothetical protein  47.2 
 
 
332 aa  209  5e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.829697  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  49.02 
 
 
283 aa  205  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0549  hypothetical protein  46.8 
 
 
284 aa  203  3e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.50892  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  47.3 
 
 
281 aa  201  8e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  45.32 
 
 
283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1197  hypothetical protein  46.3 
 
 
277 aa  199  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  43.38 
 
 
289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  43.38 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  46.24 
 
 
283 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2210  protein of unknown function DUF81  42.28 
 
 
276 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000833902  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1253  hypothetical protein  44.8 
 
 
307 aa  188  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0309797  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0268  hypothetical protein  45.19 
 
 
277 aa  183  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  46.43 
 
 
283 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1843  permease  42.86 
 
 
283 aa  180  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0940  hypothetical protein  43.03 
 
 
469 aa  178  9e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  43.51 
 
 
271 aa  155  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  32.48 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  39.45 
 
 
255 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  38.67 
 
 
255 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  39.06 
 
 
255 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2118  protein of unknown function DUF81  29.57 
 
 
324 aa  107  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00152804  normal  0.375775 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0057  protein of unknown function DUF81  26.69 
 
 
318 aa  106  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0412  hypothetical protein  28.51 
 
 
332 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.646305 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0121  hypothetical protein  26.92 
 
 
318 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1842  protein of unknown function DUF81  26.32 
 
 
324 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.130141 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2264  protein of unknown function DUF81  29.51 
 
 
329 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0708049  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1963  hypothetical protein  26.1 
 
 
305 aa  100  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0378634  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1764  protein of unknown function DUF81  27.71 
 
 
325 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2328  protein of unknown function DUF81  27.39 
 
 
318 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0941  hypothetical protein  27.56 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.892204  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0811  protein of unknown function DUF81  27.84 
 
 
379 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  29.51 
 
 
250 aa  89.7  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0175  protein of unknown function DUF81  27.4 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.537788  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0036  protein of unknown function DUF81  27.85 
 
 
318 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000168122  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1421  hypothetical protein  25.17 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0228567 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  28.73 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  27.04 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  27.57 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  27.57 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3061  protein of unknown function DUF81  30.04 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  26.62 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  25.28 
 
 
2798 aa  63.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  24.91 
 
 
257 aa  62.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  26.82 
 
 
266 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  24.9 
 
 
268 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  24.82 
 
 
310 aa  57  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  26.39 
 
 
260 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  31.3 
 
 
285 aa  56.6  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004140  predicted permease  30.73 
 
 
251 aa  55.8  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.835021  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  26.84 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1408  hypothetical protein  25.84 
 
 
264 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269239  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  26.74 
 
 
269 aa  55.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  26.84 
 
 
272 aa  55.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  25.45 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  24.63 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  27.43 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  27.43 
 
 
260 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  27.34 
 
 
305 aa  53.5  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  27.43 
 
 
260 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2913  protein of unknown function DUF81  26.86 
 
 
272 aa  53.1  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  27.11 
 
 
293 aa  52.4  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  24.63 
 
 
306 aa  52.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3690  hypothetical protein  24.88 
 
 
267 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.113603 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3379  permease  24.88 
 
 
245 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  21.93 
 
 
253 aa  52.4  0.000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0852  protein of unknown function DUF81  23.5 
 
 
317 aa  52  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3924  hypothetical protein  23.99 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.664588  normal  0.316412 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3708  hypothetical protein  25.35 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  27.37 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  22.64 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0020  hypothetical protein  31.85 
 
 
275 aa  50.8  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2484  hypothetical protein  23.31 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565244 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0349  hypothetical protein  27.16 
 
 
176 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  27.11 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  24.81 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  21.72 
 
 
253 aa  50.8  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3714  hypothetical protein  25.35 
 
 
251 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.313517  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  25.27 
 
 
259 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3781  permease  25.35 
 
 
251 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  25.89 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  25.89 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  25.45 
 
 
266 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2368  hypothetical protein  22.22 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003964  hypothetical protein  23.6 
 
 
261 aa  49.7  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224293  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  23.94 
 
 
272 aa  49.3  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01324  hypothetical protein  32.52 
 
 
263 aa  48.9  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  24.24 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  26.8 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  23.21 
 
 
253 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>