79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1421 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1421  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  544  1e-154  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0228567 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0941  hypothetical protein  35.69 
 
 
310 aa  175  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.892204  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0412  hypothetical protein  35.9 
 
 
332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.646305 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1764  protein of unknown function DUF81  35.16 
 
 
325 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1963  hypothetical protein  34.85 
 
 
305 aa  144  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0378634  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0057  protein of unknown function DUF81  34.29 
 
 
318 aa  143  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2118  protein of unknown function DUF81  35 
 
 
324 aa  143  3e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00152804  normal  0.375775 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2328  protein of unknown function DUF81  35.34 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2264  protein of unknown function DUF81  34.06 
 
 
329 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0708049  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0811  protein of unknown function DUF81  34.66 
 
 
379 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0121  hypothetical protein  37.12 
 
 
318 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1842  protein of unknown function DUF81  31.76 
 
 
324 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.130141 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0175  protein of unknown function DUF81  34.52 
 
 
311 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.537788  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0036  protein of unknown function DUF81  33.88 
 
 
318 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000168122  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0349  hypothetical protein  36.57 
 
 
176 aa  95.9  6e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  29.31 
 
 
280 aa  90.1  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  27.17 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1197  hypothetical protein  29.41 
 
 
277 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  26.83 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  26.48 
 
 
283 aa  82  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0268  hypothetical protein  29.41 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1843  permease  26.69 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  24.21 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3869  protein of unknown function DUF81  23.4 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0185467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  24.31 
 
 
277 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  25.2 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2210  protein of unknown function DUF81  27.08 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000833902  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1253  hypothetical protein  27.72 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0309797  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  26.23 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0999  protein of unknown function DUF81  24.36 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0549  hypothetical protein  30.95 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.50892  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3912  hypothetical protein  26.62 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0103404  normal  0.04978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3317  hypothetical protein  24.58 
 
 
278 aa  67  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29.6 
 
 
2798 aa  64.7  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  29.39 
 
 
283 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0943  hypothetical protein  24.75 
 
 
332 aa  63.2  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.829697  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0940  hypothetical protein  28.09 
 
 
469 aa  61.6  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  24.54 
 
 
286 aa  60.1  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  24.54 
 
 
289 aa  60.5  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3310  protein of unknown function DUF81  25.17 
 
 
278 aa  59.3  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251637  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  29.26 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  29.55 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  29.55 
 
 
305 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  30.56 
 
 
283 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  23.97 
 
 
312 aa  52.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  26.05 
 
 
306 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  22.93 
 
 
275 aa  51.6  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  26.05 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  31.85 
 
 
271 aa  50.4  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3785  hypothetical protein  26.99 
 
 
278 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.29044  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  34.78 
 
 
257 aa  50.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  27.69 
 
 
306 aa  50.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  25.95 
 
 
307 aa  49.7  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  27.05 
 
 
266 aa  49.3  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  31.61 
 
 
262 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  31.61 
 
 
266 aa  48.9  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  25.57 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  21.98 
 
 
309 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  38.46 
 
 
250 aa  48.1  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  30.77 
 
 
266 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  30.77 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  33.81 
 
 
276 aa  48.1  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  31.03 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  31.21 
 
 
266 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  31.36 
 
 
262 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  31.03 
 
 
266 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1264  hypothetical protein  29.41 
 
 
317 aa  46.2  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.194519  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  30.77 
 
 
266 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  27.52 
 
 
310 aa  45.8  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  26.47 
 
 
306 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  25.57 
 
 
305 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  35.38 
 
 
139 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  27.63 
 
 
330 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  28.57 
 
 
260 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  27.57 
 
 
306 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1487  hypothetical protein  24.21 
 
 
243 aa  42.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  23.9 
 
 
275 aa  42.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  24.23 
 
 
308 aa  42.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  36.7 
 
 
265 aa  42.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>