84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1963 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1963  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0378634  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2328  protein of unknown function DUF81  82.61 
 
 
318 aa  436  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1842  protein of unknown function DUF81  79.78 
 
 
324 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.130141 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0057  protein of unknown function DUF81  64.26 
 
 
318 aa  360  2e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0121  hypothetical protein  67.24 
 
 
318 aa  348  9e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1764  protein of unknown function DUF81  58.2 
 
 
325 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0412  hypothetical protein  57.64 
 
 
332 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.646305 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2118  protein of unknown function DUF81  58.21 
 
 
324 aa  299  4e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00152804  normal  0.375775 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0036  protein of unknown function DUF81  62.32 
 
 
318 aa  295  4e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000168122  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2264  protein of unknown function DUF81  58.19 
 
 
329 aa  291  7e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0708049  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0811  protein of unknown function DUF81  61.23 
 
 
379 aa  288  9e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0175  protein of unknown function DUF81  59.86 
 
 
311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.537788  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0941  hypothetical protein  35.84 
 
 
310 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.892204  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1421  hypothetical protein  34.85 
 
 
288 aa  147  3e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0228567 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  31.67 
 
 
281 aa  132  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  27.84 
 
 
276 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  28.4 
 
 
278 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3869  protein of unknown function DUF81  28.26 
 
 
277 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0185467  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0999  protein of unknown function DUF81  26.42 
 
 
286 aa  112  9e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1253  hypothetical protein  27.6 
 
 
307 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0309797  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1197  hypothetical protein  28.94 
 
 
277 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0268  hypothetical protein  28.57 
 
 
277 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  25.7 
 
 
283 aa  105  7e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0943  hypothetical protein  26.69 
 
 
332 aa  105  8e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.829697  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  26.1 
 
 
283 aa  105  9e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  27.78 
 
 
280 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  26.1 
 
 
283 aa  104  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  24.6 
 
 
277 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0940  hypothetical protein  25.98 
 
 
469 aa  104  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1843  permease  26.52 
 
 
283 aa  103  4e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  29.26 
 
 
289 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  29.26 
 
 
286 aa  103  5e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0349  hypothetical protein  36.9 
 
 
176 aa  102  6e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3912  hypothetical protein  25.4 
 
 
278 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0103404  normal  0.04978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3310  protein of unknown function DUF81  25.51 
 
 
278 aa  95.9  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251637  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  26.56 
 
 
271 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  26.29 
 
 
283 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0549  hypothetical protein  22.62 
 
 
284 aa  91.7  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.50892  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  25.9 
 
 
283 aa  90.5  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2210  protein of unknown function DUF81  24.35 
 
 
276 aa  88.6  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000833902  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3317  hypothetical protein  25 
 
 
278 aa  82.8  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  24.22 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3785  hypothetical protein  25.69 
 
 
278 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.29044  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  24.26 
 
 
266 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  28 
 
 
250 aa  58.9  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  29.63 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  29.94 
 
 
262 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  29.63 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  29.94 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  29.94 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  29.63 
 
 
266 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  29.94 
 
 
266 aa  57.8  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  29.63 
 
 
266 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  29.63 
 
 
266 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0520  hypothetical protein  28.14 
 
 
265 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.422648 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  22.13 
 
 
2798 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  38.82 
 
 
269 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  25.79 
 
 
255 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  26.19 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0487  hypothetical protein  27.76 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0808149 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  26.19 
 
 
255 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0541  hypothetical protein  28.8 
 
 
261 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.71151  normal  0.0781963 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  27.72 
 
 
267 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  27.84 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  22.97 
 
 
255 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  30.28 
 
 
139 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0852  protein of unknown function DUF81  24.81 
 
 
317 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799612  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  27.66 
 
 
277 aa  46.6  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  28.04 
 
 
345 aa  46.6  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  26.23 
 
 
270 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  30.38 
 
 
260 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2255  hypothetical protein  30.26 
 
 
671 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00144777  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
285 aa  44.3  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  23.66 
 
 
270 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  24.29 
 
 
266 aa  43.9  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  26.54 
 
 
269 aa  43.5  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  25.1 
 
 
300 aa  43.5  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  24.72 
 
 
253 aa  43.1  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  30.77 
 
 
259 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  25.47 
 
 
245 aa  43.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  24.62 
 
 
253 aa  43.1  0.006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  30.77 
 
 
259 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  23.57 
 
 
312 aa  42.7  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  25.47 
 
 
307 aa  42.7  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>