96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0412 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0412  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  639    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.646305 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1764  protein of unknown function DUF81  84.49 
 
 
325 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2264  protein of unknown function DUF81  77.33 
 
 
329 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0708049  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0811  protein of unknown function DUF81  79.13 
 
 
379 aa  431  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2118  protein of unknown function DUF81  78.01 
 
 
324 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00152804  normal  0.375775 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1963  hypothetical protein  60.36 
 
 
305 aa  315  6e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0378634  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0057  protein of unknown function DUF81  54.79 
 
 
318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0175  protein of unknown function DUF81  63.83 
 
 
311 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.537788  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2328  protein of unknown function DUF81  59.21 
 
 
318 aa  291  1e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1842  protein of unknown function DUF81  56.38 
 
 
324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.130141 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0036  protein of unknown function DUF81  55.21 
 
 
318 aa  263  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000168122  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0121  hypothetical protein  54.09 
 
 
318 aa  262  6.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0941  hypothetical protein  37.18 
 
 
310 aa  169  7e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.892204  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1421  hypothetical protein  35.9 
 
 
288 aa  156  4e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0228567 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  35.42 
 
 
281 aa  136  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  28.08 
 
 
276 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  29.78 
 
 
280 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  24.91 
 
 
278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3912  hypothetical protein  27.71 
 
 
278 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0103404  normal  0.04978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3310  protein of unknown function DUF81  27.07 
 
 
278 aa  106  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251637  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3869  protein of unknown function DUF81  26.32 
 
 
277 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0185467  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1197  hypothetical protein  27.44 
 
 
277 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0549  hypothetical protein  26.29 
 
 
284 aa  100  4e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.50892  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2210  protein of unknown function DUF81  26.1 
 
 
276 aa  99.4  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000833902  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  26.79 
 
 
283 aa  99.4  8e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3317  hypothetical protein  26.24 
 
 
278 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  23.39 
 
 
277 aa  97.4  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0999  protein of unknown function DUF81  24.53 
 
 
286 aa  97.4  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0268  hypothetical protein  27.44 
 
 
277 aa  96.3  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1253  hypothetical protein  24 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0309797  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  26.27 
 
 
283 aa  94  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  28.47 
 
 
271 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0349  hypothetical protein  35.93 
 
 
176 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1843  permease  25.56 
 
 
283 aa  90.9  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  24.91 
 
 
283 aa  89.4  8e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0940  hypothetical protein  25.3 
 
 
469 aa  87.8  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3785  hypothetical protein  29.84 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.29044  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0943  hypothetical protein  24.4 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.829697  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  23.89 
 
 
283 aa  79  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  23.02 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  25.99 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  24.59 
 
 
289 aa  73.2  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  24.59 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  33.12 
 
 
250 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  26.63 
 
 
255 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  26.13 
 
 
255 aa  57.4  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0852  protein of unknown function DUF81  26.22 
 
 
317 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  26.13 
 
 
255 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  24.79 
 
 
266 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  27.09 
 
 
261 aa  49.7  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  41.03 
 
 
269 aa  49.7  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  24.35 
 
 
275 aa  49.7  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  24.35 
 
 
275 aa  49.7  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  24.41 
 
 
354 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  26.71 
 
 
275 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  35.76 
 
 
285 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1264  hypothetical protein  22.65 
 
 
317 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.194519  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  24.69 
 
 
267 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  28.83 
 
 
315 aa  46.6  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  31.09 
 
 
285 aa  46.2  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2471  hypothetical protein  33.03 
 
 
257 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2539  hypothetical protein  33.03 
 
 
257 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.52018  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2631  hypothetical protein  33.03 
 
 
257 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0520  hypothetical protein  27.63 
 
 
265 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.422648 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  29.06 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2787  hypothetical protein  28.33 
 
 
259 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.369354  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  25.33 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  29.06 
 
 
296 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2926  protein of unknown function DUF81  27.05 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  25.21 
 
 
2798 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  31.11 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  27.97 
 
 
306 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  31.11 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  30.39 
 
 
350 aa  44.3  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  26.49 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  31.11 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  26.49 
 
 
266 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  25.19 
 
 
266 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  26.49 
 
 
262 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  29.9 
 
 
270 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0487  hypothetical protein  27.65 
 
 
265 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0808149 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  26.49 
 
 
262 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  32.43 
 
 
291 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  23.21 
 
 
312 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  26.49 
 
 
266 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  26.49 
 
 
266 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0600  hypothetical protein  27.96 
 
 
245 aa  43.5  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250139  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  28.19 
 
 
307 aa  43.1  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  24.67 
 
 
266 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  27.97 
 
 
306 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  27.09 
 
 
256 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  28.7 
 
 
345 aa  42.7  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  25.81 
 
 
253 aa  42.7  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  31.11 
 
 
291 aa  42.7  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1533  permease  21.81 
 
 
251 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0311144 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  29.9 
 
 
270 aa  42.7  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>