More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1828 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  98.63 
 
 
291 aa  540  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  85.77 
 
 
291 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  85.41 
 
 
291 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  85.41 
 
 
291 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  86.12 
 
 
291 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  66.81 
 
 
303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  65.04 
 
 
299 aa  260  1e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5752  hypothetical protein  62.98 
 
 
292 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  56.25 
 
 
291 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  68.53 
 
 
298 aa  226  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  67.36 
 
 
255 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  64.47 
 
 
257 aa  218  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1213  hypothetical protein  66.53 
 
 
296 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.859295  normal  0.0653878 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  45.9 
 
 
254 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  50.22 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  41.67 
 
 
268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  39.66 
 
 
266 aa  160  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  38.19 
 
 
265 aa  155  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  42.49 
 
 
282 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  38.56 
 
 
277 aa  149  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21660  predicted permease  53.3 
 
 
256 aa  148  8e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  42.98 
 
 
254 aa  146  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  37.97 
 
 
267 aa  144  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  44 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  38.49 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  35.71 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  40.85 
 
 
252 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  40.48 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  34.62 
 
 
266 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  42.17 
 
 
275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2579  protein of unknown function DUF81  42.13 
 
 
275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000157128  decreased coverage  0.0000347333 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  39.91 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2679  hypothetical protein  42.17 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  44.29 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3363  hypothetical protein  44.7 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133866  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  38.55 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  38.05 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  38.43 
 
 
256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  37.17 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  37.17 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  37.17 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  36.8 
 
 
302 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4872  hypothetical protein  32.78 
 
 
261 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0137223  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  40.08 
 
 
265 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  37.61 
 
 
256 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  39 
 
 
286 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  40.67 
 
 
254 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  31.25 
 
 
270 aa  96.3  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  34.03 
 
 
290 aa  94.7  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  30.88 
 
 
270 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  40.76 
 
 
250 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0458  hypothetical protein  41.12 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  40.13 
 
 
250 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  38.26 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  29.81 
 
 
270 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  32 
 
 
267 aa  90.9  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1573  hypothetical protein  34.47 
 
 
259 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  42.6 
 
 
261 aa  90.1  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4622  hypothetical protein  40.54 
 
 
267 aa  90.1  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.479297  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  31.3 
 
 
293 aa  89.4  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  40 
 
 
267 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  31.3 
 
 
255 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  39.29 
 
 
272 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  33.47 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  30.67 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  30 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1801  hypothetical membrane spanning protein  31.19 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3834  hypothetical protein  36.24 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  28.46 
 
 
267 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2471  hypothetical protein  37.02 
 
 
257 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4660  hypothetical protein  33.89 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  38 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3835  hypothetical protein  34.31 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1101  hypothetical protein  35.8 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  normal  0.139466 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  30.57 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  29.2 
 
 
273 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30740  predicted permease  44.32 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4664  protein of unknown function DUF81  36.72 
 
 
253 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.900515  normal  0.541458 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  30.83 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  25.69 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  25.3 
 
 
2798 aa  73.2  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3050  hypothetical protein  35.27 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0350  hypothetical protein  36.84 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.569442  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  29.38 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  26.78 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4144  protein of unknown function DUF81  38.55 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  31.98 
 
 
273 aa  72  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  30.42 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  30.29 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  27.83 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  27.83 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  38.1 
 
 
117 aa  70.5  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  29.55 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  27.83 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4148  protein of unknown function DUF81  43.75 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979018  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  27.83 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  27.83 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  27.83 
 
 
262 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  27.83 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>