86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2328 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2328  protein of unknown function DUF81  100 
 
 		 318 aa  614  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1963  hypothetical protein  85.77 
 
 		 305 aa  455  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0378634  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0057  protein of unknown function DUF81  62.26 
 
 		 318 aa  375  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1842  protein of unknown function DUF81  72.17 
 
 		 324 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.130141 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0121  hypothetical protein  68.56 
 
 		 318 aa  364  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0036  protein of unknown function DUF81  62.9 
 
 		 318 aa  299  5e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000168122  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1764  protein of unknown function DUF81  59.57 
 
 		 325 aa  296  4e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0412  hypothetical protein  59.21 
 
 		 332 aa  296  5e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.646305 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2118  protein of unknown function DUF81  56.43 
 
 		 324 aa  293  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00152804  normal  0.375775 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2264  protein of unknown function DUF81  57.61 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0708049  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0811  protein of unknown function DUF81  58.7 
 
 		 379 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0175  protein of unknown function DUF81  58.06 
 
 		 311 aa  278  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.537788  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0941  hypothetical protein  34.89 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.892204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1421  hypothetical protein  35.9 
 
 		 288 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0228567 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  27.21 
 
 		 276 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  32.78 
 
 		 281 aa  123  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0999  protein of unknown function DUF81  26.42 
 
 		 286 aa  117  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1253  hypothetical protein  26.59 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0309797  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  28.02 
 
 		 278 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  26.21 
 
 		 283 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1197  hypothetical protein  30.45 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  27.47 
 
 		 283 aa  109  6e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0349  hypothetical protein  38.1 
 
 		 176 aa  108  1e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3310  protein of unknown function DUF81  27.42 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251637  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0268  hypothetical protein  27.87 
 
 		 277 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3869  protein of unknown function DUF81  25.72 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0185467  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0943  hypothetical protein  26 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.829697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0940  hypothetical protein  25.98 
 
 		 469 aa  104  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  27.37 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  26.36 
 
 		 271 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1843  permease  25.76 
 
 		 283 aa  102  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  23.89 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  26.01 
 
 		 283 aa  99.8  6e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  27.09 
 
 		 286 aa  99.4  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  27.09 
 
 		 289 aa  99  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0549  hypothetical protein  23.92 
 
 		 284 aa  95.9  7e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.50892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  27.49 
 
 		 283 aa  94.4  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  27.09 
 
 		 283 aa  92.8  6e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3912  hypothetical protein  24.68 
 
 		 278 aa  90.5  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0103404  normal  0.04978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2210  protein of unknown function DUF81  24.35 
 
 		 276 aa  89.7  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000833902  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3317  hypothetical protein  26.39 
 
 		 278 aa  89  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  25.1 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3785  hypothetical protein  27.82 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.29044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  28.21 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  24.72 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  26.11 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  26.11 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  26.11 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  26.11 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  26.11 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  26.11 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  26.37 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  28.79 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  26.7 
 
 		 266 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  26.7 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  25.94 
 
 		 255 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  26.72 
 
 		 255 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  27.16 
 
 		 255 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0852  protein of unknown function DUF81  25.19 
 
 		 317 aa  52.8  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799612  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0247  hypothetical protein  24.32 
 
 		 277 aa  50.4  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  21.66 
 
 		 255 aa  50.1  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  37.65 
 
 		 269 aa  49.7  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  26.15 
 
 		 267 aa  49.3  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  24.54 
 
 		 253 aa  49.3  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0520  hypothetical protein  27.08 
 
 		 265 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.422648 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  23.27 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  28.66 
 
 		 260 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  25.28 
 
 		 272 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  27.56 
 
 		 305 aa  45.8  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0487  hypothetical protein  26.71 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0808149 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  24.04 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0541  hypothetical protein  27.03 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.71151  normal  0.0781963 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 		 345 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  23.79 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  23.4 
 
 		 2798 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  25.56 
 
 		 270 aa  43.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  24.44 
 
 		 272 aa  43.1  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  22.1 
 
 		 253 aa  42.7  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  24.44 
 
 		 261 aa  42.7  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  33.33 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2787  hypothetical protein  27.42 
 
 		 259 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.369354  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  28.87 
 
 		 268 aa  42.7  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  23.55 
 
 		 260 aa  42.7  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  28.32 
 
 		 266 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  22.35 
 
 		 266 aa  42.4  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  23.56 
 
 		 270 aa  42.4  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>