More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1182 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
290 aa  565  1e-160  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  43.33 
 
 
273 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  40.82 
 
 
273 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  42.96 
 
 
273 aa  142  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  40.31 
 
 
273 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  38.06 
 
 
276 aa  132  9e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  36.33 
 
 
269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  37.4 
 
 
268 aa  127  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  38.96 
 
 
285 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  36.43 
 
 
268 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  36.8 
 
 
270 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  38.41 
 
 
331 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  37.83 
 
 
272 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  37.02 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  37.26 
 
 
272 aa  120  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  36.88 
 
 
268 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  36.78 
 
 
267 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  36.78 
 
 
268 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  40.08 
 
 
272 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  34.52 
 
 
272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  39.29 
 
 
272 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  34.7 
 
 
268 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  32.3 
 
 
268 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  34.15 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  34.6 
 
 
268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  34.6 
 
 
268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  38.15 
 
 
272 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  34.35 
 
 
268 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  34.13 
 
 
291 aa  109  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  36.08 
 
 
257 aa  109  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  37.82 
 
 
266 aa  109  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  33.09 
 
 
293 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  33.77 
 
 
299 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  34.73 
 
 
268 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  33.47 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  34.6 
 
 
268 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  34.35 
 
 
268 aa  105  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1791  hypothetical protein  32.85 
 
 
282 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  33.92 
 
 
279 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2895  hypothetical protein  36.33 
 
 
277 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.766494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  34.66 
 
 
302 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  34.94 
 
 
266 aa  99  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  32.73 
 
 
254 aa  97.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  36.03 
 
 
271 aa  97.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  28.4 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  30.83 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1980  hypothetical protein  34.07 
 
 
250 aa  95.9  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  31.62 
 
 
291 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  31.62 
 
 
291 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  31.62 
 
 
291 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  28.15 
 
 
305 aa  95.5  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  36.51 
 
 
291 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  32.65 
 
 
303 aa  92.8  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  33.76 
 
 
250 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  31.05 
 
 
265 aa  92.4  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  35.98 
 
 
291 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  31.56 
 
 
268 aa  92  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  33.33 
 
 
250 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  35.98 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1902  membrane protein  31.1 
 
 
255 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  37.1 
 
 
261 aa  89.4  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1809  hypothetical protein  34.68 
 
 
264 aa  88.6  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  33.91 
 
 
286 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0002  protein of unknown function DUF81  30.31 
 
 
267 aa  88.6  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  32.13 
 
 
268 aa  86.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  32.05 
 
 
298 aa  86.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  31.29 
 
 
276 aa  86.3  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  35.89 
 
 
257 aa  86.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  34.55 
 
 
275 aa  86.3  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  32.02 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  29.53 
 
 
308 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  31.4 
 
 
277 aa  84.3  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  31.62 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  26.16 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  29.37 
 
 
307 aa  83.2  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  30.85 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  30.85 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  29.67 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  32.21 
 
 
307 aa  82  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  27.24 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  25.58 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  27.89 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  31.68 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1204  hypothetical protein  32.94 
 
 
262 aa  80.5  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.121226  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  25.58 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  31.62 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  31.62 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  27.31 
 
 
306 aa  79  0.00000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  27.49 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  27.11 
 
 
315 aa  79  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  28.15 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  31.48 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  26.32 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  33.47 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  26.02 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  28.36 
 
 
305 aa  75.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  26.97 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  28.36 
 
 
296 aa  75.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0360  hypothetical protein  33.46 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2721  protein of unknown function DUF81  35.32 
 
 
254 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>