225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5348 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5348  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  627  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.57762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  72.38 
 
 		 273 aa  336  3.9999999999999995e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  69.58 
 
 		 272 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  63.48 
 
 		 273 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  63.12 
 
 		 273 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  60 
 
 		 273 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  54.74 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  49.1 
 
 		 269 aa  229  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  52.03 
 
 		 270 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0054  hypothetical protein  56.76 
 
 		 285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  53.26 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0355  protein of unknown function DUF81  47.89 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.397221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0073  hypothetical protein  57.09 
 
 		 272 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268722  hitchhiker  0.000000124112 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  48.48 
 
 		 268 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0070  hypothetical protein  57.09 
 
 		 272 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.791848  hitchhiker  0.000000308112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0070  hypothetical protein  57.14 
 
 		 272 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.96847  hitchhiker  0.00978296 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0360  hypothetical protein  48.5 
 
 		 254 aa  169  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3457  hypothetical protein  46.47 
 
 		 266 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242183 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2280  hypothetical protein  46.15 
 
 		 268 aa  153  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.645402  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0673  hypothetical protein  45.68 
 
 		 267 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2305  hypothetical protein  48.25 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2174  hypothetical protein  48.25 
 
 		 268 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.290408  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2118  hypothetical protein  48.25 
 
 		 268 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.763231  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  41.52 
 
 		 268 aa  149  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1668  hypothetical protein  44.36 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.466338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1809  hypothetical protein  46.64 
 
 		 264 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6332  hypothetical protein  44.81 
 
 		 268 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1671  hypothetical protein  44.36 
 
 		 268 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1747  hypothetical protein  44.81 
 
 		 268 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.418436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  45.19 
 
 		 268 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5045  hypothetical protein  44.07 
 
 		 268 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1513  hypothetical protein  45.09 
 
 		 268 aa  143  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.62099  normal  0.667086 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  40.45 
 
 		 268 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  37.01 
 
 		 290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  40.53 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  27.78 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  34.32 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2702  protein of unknown function DUF81  35.94 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2294  hypothetical protein  32.37 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000192457 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  30.66 
 
 		 2798 aa  78.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1689  protein of unknown function DUF81  32.78 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218767 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  28.85 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  28.85 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5834  hypothetical protein  33.59 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  25.91 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  24.6 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  30.61 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6175  protein of unknown function DUF81  26.47 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  33.04 
 
 		 250 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  28.68 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  33.04 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  31.8 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  28.87 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1641  hypothetical protein  29.25 
 
 		 252 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  28.87 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  28.87 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3084  membrane permease protein  37.71 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12623  hypothetical protein  26.25 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  30.04 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  28 
 
 		 266 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0368  protein of unknown function DUF81  33.77 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.461957  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  25.3 
 
 		 268 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1361  hypothetical protein  31.76 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0836197  normal  0.101399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  28.87 
 
 		 291 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2398  protein of unknown function DUF81  34.43 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2775  membrane protein  34.43 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  28.87 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4015  hypothetical protein  31.75 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4089  hypothetical protein  31.75 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4245  hypothetical protein  31.75 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468612  normal  0.0890786 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  26.2 
 
 		 308 aa  63.5  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  24.19 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  26.25 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  27.97 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  28.12 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  28.3 
 
 		 280 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  28.12 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  26.56 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3621  hypothetical protein  28.69 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  31.63 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  24.54 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  30.13 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6796  hypothetical protein  29.37 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.242405 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  30.74 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  24.52 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0364  hypothetical protein  32.75 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000703082 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  24.52 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  30.7 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0204  protein of unknown function DUF81  25.11 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  27.04 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  26.59 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  28.06 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1104  hypothetical protein  28.35 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  30.85 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  22.35 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0360  protein of unknown function DUF81  33.47 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  25.36 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0935  hypothetical protein  32.11 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.142385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  28.93 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0549  hypothetical protein  35.24 
 
 		 284 aa  55.1  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.50892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>