57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3621 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3621  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  482  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  86.35 
 
 
251 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2089  hypothetical protein  43.57 
 
 
252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2787  hypothetical protein  25.41 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.369354  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0246  hypothetical protein  31.63 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0326484  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  33 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  29.82 
 
 
281 aa  63.5  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1901  protein of unknown function DUF81  22.05 
 
 
247 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.407274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  30.53 
 
 
291 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  30.53 
 
 
291 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  30.53 
 
 
291 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  30.58 
 
 
291 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  31.38 
 
 
291 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  30.85 
 
 
291 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  40.4 
 
 
119 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  27.23 
 
 
299 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  29.52 
 
 
291 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  28.29 
 
 
268 aa  53.5  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  30.77 
 
 
257 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  38 
 
 
121 aa  52.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  33.8 
 
 
258 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2182  protein of unknown function DUF81  22.75 
 
 
244 aa  49.7  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000194994  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2628  protein of unknown function DUF81  33.65 
 
 
252 aa  49.3  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.78898  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  25.26 
 
 
254 aa  48.9  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  27.82 
 
 
268 aa  48.9  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  26.32 
 
 
307 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  28.91 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0266  protein of unknown function DUF81  31.63 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.468976  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  29.05 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  27.17 
 
 
264 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  30.16 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  24.59 
 
 
283 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  32.46 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  25.91 
 
 
307 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  32.14 
 
 
270 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  31.71 
 
 
273 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  27.07 
 
 
315 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  29.26 
 
 
250 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  33.05 
 
 
272 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  32.91 
 
 
307 aa  45.8  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  28.36 
 
 
273 aa  45.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  24.65 
 
 
242 aa  45.4  0.0009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  29.37 
 
 
268 aa  44.7  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  25.9 
 
 
308 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1182  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
290 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.337367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  23.01 
 
 
303 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  26.6 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  23.9 
 
 
304 aa  43.9  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0542  hypothetical protein  22.76 
 
 
263 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.768311  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0366  hypothetical protein  41.54 
 
 
278 aa  42.7  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2735  hypothetical protein  28.16 
 
 
266 aa  42.7  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  25.61 
 
 
306 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2446  hypothetical protein  26.27 
 
 
247 aa  42.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.335155  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2931  hypothetical protein  34.02 
 
 
240 aa  42  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1681  hypothetical protein  27.68 
 
 
276 aa  42  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  36.84 
 
 
305 aa  42  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>