68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2089 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2089  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  484  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3672  protein of unknown function DUF81  43.61 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3621  hypothetical protein  44.24 
 
 		 251 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0174  hypothetical protein  29.81 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  29.07 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  37.74 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  35.71 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  28.24 
 
 		 268 aa  57.4  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  27.72 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2167  hypothetical protein  30 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.720492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0917  hypothetical protein  28.98 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  38.24 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1670  hypothetical protein  35.71 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16949  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19390  hypothetical protein  38.05 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0420462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6243  hypothetical protein  30 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2015  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.788347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  24.39 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  28.91 
 
 		 291 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3591  hypothetical protein  33.33 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  24.37 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  28.91 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  28.91 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  27.4 
 
 		 291 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0568  protein of unknown function DUF81  24.6 
 
 		 264 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  27.05 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  27.43 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2787  hypothetical protein  21.77 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.369354  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  26.44 
 
 		 291 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2250  hypothetical protein  32.14 
 
 		 268 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0080  hypothetical protein  27.84 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0246  hypothetical protein  28.16 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0326484  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  38.57 
 
 		 306 aa  48.9  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  34.38 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1707  protein of unknown function DUF81  31.15 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.230326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  24.43 
 
 		 265 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  34.25 
 
 		 307 aa  48.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1943  hypothetical protein  30.73 
 
 		 260 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  24.76 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  27.87 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1881  hypothetical protein  30.07 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  36 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0108  hypothetical protein  26.15 
 
 		 272 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1325  hypothetical protein  25.81 
 
 		 246 aa  46.6  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199061  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  36.49 
 
 		 307 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  28.02 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1233  hypothetical protein  30.23 
 
 		 242 aa  46.2  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  36.49 
 
 		 307 aa  45.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2428  protein of unknown function DUF81  29.82 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0171804  normal  0.118063 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  29.03 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  33.71 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  36.49 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2397  hypothetical protein  27.13 
 
 		 268 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000157692  hitchhiker  0.0000225629 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1901  protein of unknown function DUF81  22.03 
 
 		 247 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.407274  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  25.68 
 
 		 255 aa  44.3  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  24.41 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  28.65 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  31.17 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1353  hypothetical protein  25.96 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  25.57 
 
 		 2798 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2830  protein of unknown function DUF81  26.83 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0755  hypothetical protein  24.65 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0798  hypothetical protein  25.19 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0341  hypothetical protein  33.87 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2223  hypothetical protein  29.8 
 
 		 298 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.361193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1829  hypothetical protein  31.55 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1541  hypothetical protein  30.08 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0528379 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1763  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.844244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  33.87 
 
 		 330 aa  42.4  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>