39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1325 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1325  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  477  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199061  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2830  protein of unknown function DUF81  46.78 
 
 
245 aa  179  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0807  hypothetical protein  43.91 
 
 
252 aa  142  5e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2071  protein of unknown function DUF81  42.86 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000024156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2150  protein of unknown function DUF81  42.54 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4643  hypothetical protein  42.11 
 
 
248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1646  transmembrane protein  34.89 
 
 
247 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.337774  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3166  hypothetical protein  34.87 
 
 
307 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.287398  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1500  protein of unknown function DUF81  37.76 
 
 
249 aa  102  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1252  putative transmembrane protein  42.98 
 
 
141 aa  96.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2717  hypothetical protein  34.31 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.216338  normal  0.140685 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  29.34 
 
 
242 aa  62.8  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2084  hypothetical protein  25.16 
 
 
299 aa  55.1  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.317209  normal  0.0878146 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0246  hypothetical protein  28.36 
 
 
257 aa  55.1  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0326484  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  26.46 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  30.68 
 
 
266 aa  48.9  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2089  hypothetical protein  25.81 
 
 
252 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1164  hypothetical protein  28.24 
 
 
246 aa  46.6  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344756  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  27.68 
 
 
291 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  26.14 
 
 
291 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6931  protein of unknown function DUF81  30.49 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2926  protein of unknown function DUF81  29.55 
 
 
318 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2036  protein of unknown function DUF81  30.61 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0368632  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  31.87 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  23.74 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  26.14 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  25.12 
 
 
291 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  25.12 
 
 
291 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8588  hypothetical protein  25.1 
 
 
317 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.633076  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  23.43 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  26.04 
 
 
275 aa  43.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26650  predicted permease  23.9 
 
 
253 aa  43.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0286343  normal  0.726382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0983  hypothetical protein  24.43 
 
 
291 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  25.12 
 
 
291 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2102  protein of unknown function DUF81  28.47 
 
 
246 aa  42.7  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.691582  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  25.39 
 
 
275 aa  43.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  25.39 
 
 
275 aa  43.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  32.89 
 
 
270 aa  42.4  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  31.4 
 
 
270 aa  42  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>